RNA–Protein interactions for RNA: YDL193W

NUS1, Transcript of Putative prenyltransferase, yeast

Gene NUS1, Length 1,128 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NUS1	YDL193W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	MRPL22	P53881	309 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	MDM1	Q01846	1127 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	VHS3	Q08438	674 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	HIF1	Q12373	385 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	YLR415C	O13578	112 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	INH1	P01097	85 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	GAL10	P04397	699 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	HIS5	P07172	385 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	YCR015C	P25616	317 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	MCM10	P32354	571 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	BEM3	P32873	1128 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	MRPL36	P36531	177 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	SIC1	P38634	284 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	SWD1	P39706	426 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	EAF5	P39995	279 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	MNT3	P40549	630 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	SMK1	P41808	388 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	PFA3	P42836	336 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	UBA2	P52488	636 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	SPO14	P36126	1683 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	CWH43	P25618	953 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	VHR1	P40522	640 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	PXA1	P41909	870 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	TAF4	P50105	388 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	SNO2	P53823	222 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	SGD1	Q06132	899 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	GPR1	Q12361	961 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	PHO5	P00635	467 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	ADH4	P10127	382 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	MTF2	P10849	440 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	CBP3	P21560	335 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	YCL049C	P25577	312 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	STE14	P32584	239 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	NPR3	P38742	1146 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	ERR3	P42222	437 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	MAD3	P47074	515 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	PEF1	P53238	335 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	SPC19	Q03954	165 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	CIA1	Q05583	330 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	YPS7	Q06325	596 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	STP4	Q07351	490 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	CRD1	Q07560	283 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	SGO1	Q08490	590 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	HOS1	Q12214	470 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	NUC1	P08466	329 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	SLC1	P33333	303 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	THI80	P35202	319 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	GIP4	P39732	760 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	CHA4	P43634	648 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	SAP4	P53036	818 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	SPO1	P53541	631 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	TRM11	Q12463	433 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	SIR1	P21691	654 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	KIN82	P25341	720 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	YHR033W	P38690	423 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	UME6	P39001	836 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	SPC72	P39723	622 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	MAD2	P40958	196 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	MNT2	P53059	558 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	NCS6	P53088	359 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	ARA2	Q04212	335 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	RXT3	Q07458	294 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NUS1	YDL193W	MED1	Q12321	566 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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