RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

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Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM259Q4ZIN3 620 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 RFX6Q8HWS3 928 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 LINC01599Q8WXQ3 324 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 CCDC138Q96M89 665 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 HES7Q9BYE0 225 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 ANO2Q9NQ90 1003 aa-1.22□□□□□ -2.6
SNORD54-201ENST00000459159 NR2E1Q9Y466 385 aa-1.22□□□□□ -2.6
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SNORD54-201ENST00000459159 C17orf102A2RUQ5 167 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 KRBA1A5PL33 1030 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 DCAF8L1A6NGE4 600 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa-1.23□□□□□ -2.61
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SNORD54-201ENST00000459159 KDM4AO75164 1064 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 C1QCP02747 245 aa-1.23□□□□□ -2.61
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SNORD54-201ENST00000459159 CELA3AP09093 270 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 TACSTD2P09758 323 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 HES1Q14469 280 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 ST3GAL2Q16842 350 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 COL28A1Q2UY09 1125 aa-1.23□□□□□ -2.61
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SNORD54-201ENST00000459159 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 TCTN3Q6NUS6 607 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa-1.23□□□□□ -2.61
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SNORD54-201ENST00000459159 REPS2Q8NFH8 660 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP-1.23□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 KIF12Q96FN5 646 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP-1.23□□□□□ -2.61
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SNORD54-201ENST00000459159 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 REEP1Q9H902 201 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 PELI2Q9HAT8 420 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP-1.23□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 WASH6PQ9NQA3 447 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP-1.23□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 CHIC2Q9UKJ5 165 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP-1.23□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 COL4A6Q14031 1691 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 KAT6AQ92794 2004 aa-1.23□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa-1.24□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP-1.24□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 TRIM13O60858 407 aa-1.24□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 LRP3O75074 770 aa-1.24□□□□□ -2.61
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SNORD54-201ENST00000459159 LIG1P18858 919 aa-1.24□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 AMY2BP19961 511 aa-1.24□□□□□ -2.61
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SNORD54-201ENST00000459159 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP-1.24□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 CSRP3P50461 194 aa-1.24□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 FOXC1Q12948 553 aa-1.24□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 MOGSQ13724 837 aa-1.24□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 KLK9Q2XQG4 91 aa-1.24□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 METTL24Q5JXM2 366 aa-1.24□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 LDLRAD1Q5T700 205 aa-1.24□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 MSL1Q68DK7 614 aa-1.24□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP-1.24□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 KRT25Q7Z3Z0 450 aa-1.24□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 DAAM2Q86T65 1068 aa-1.24□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP-1.24□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 LINC01356Q8N9X3 169 aa-1.24□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP-1.24□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 DPF3Q92784 378 aa-1.24□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 TMBIM1Q969X1 311 aa-1.24□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 MBD6Q96DN6 1003 aa-1.24□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 DNAJA3Q96EY1 480 aa-1.24□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 WNK4Q96J92 1243 aa-1.24□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 ARID3AQ99856 593 aa-1.24□□□□□ -2.61
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SNORD54-201ENST00000459159 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa-1.24□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF446Q9NWS9 450 aa-1.24□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa-1.24□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 ABCA7Q8IZY2 2146 aa-1.24□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 ZMYM3Q14202 1370 aa-1.24□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 LAMC1P11047 1609 aa-1.25□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 COL4A5P29400 1685 aa-1.25□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 LCE6AA0A183 80 aa-1.25□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 WASH4PA8MWX3 477 aa-1.25□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 GRXCR1A8MXD5 290 aa-1.25□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 ISM1B1AKI9 464 aa-1.25□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 SHISA9B4DS77 424 aa-1.25□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 RTL8CO15255 209 aa-1.25□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP-1.25□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 CTAG2O75638 210 aa-1.25□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 TRPA1O75762 1119 aa-1.25□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 SLC16A8O95907 504 aa-1.25□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 NDUFV2P19404 249 aa-1.25□□□□□ -2.61
SNORD54-201ENST00000459159 NR1D1P20393 614 aa-1.25□□□□□ -2.61
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