RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Shisa4Q8CA71 197 aa18.51■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Psmb7P70195 277 aa18.5■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trak2Q6P9N8 913 aa18.5■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ncaph2Q8BSP2 607 aa18.5■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tnni2P13412 182 aa18.5■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Btn2a2A4QPC6 514 aa18.5■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Metap2O08663 478 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CrcpO35427 148 aa18.5■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kif2aP28740 705 aa18.5■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trim52Q8CDV4 233 aa18.5■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nid2O88322 1403 aa18.5■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc1a4O35874 532 aa18.49■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp26a1O55127 497 aa18.49■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Llgl2Q3TJ91 1027 aa18.49■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fez2Q6TYB5 348 aa18.49■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zswim4Q8C7B8 1101 aa18.49■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bcl11bQ99PV8 884 aa18.49■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GmnnO88513 206 aa18.49■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm12185Q5NCB2 835 aa18.49■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp7a1Q64505 503 aa18.49■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Edrf1Q6GQV7 1239 aa18.49■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sos2Q02384 1333 aa18.49■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 LtkP08923 888 aa18.48■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Anks1aP59672 1150 aa18.48■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pfkfb1P70266 471 aa18.48■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tpcn2Q8BWC0 731 aa18.48■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trim59Q922Y2 403 aa18.48■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm3409A0A0G2JE67 319 aa18.48■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kmt5bQ3U8K7 883 aa18.48■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ZyxQ62523 564 aa18.48■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slfnl1Q8BHW9 410 aa18.48■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ktn1Q61595 1327 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp3a57D3YYZ0 503 aa18.48■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp2d9P11714 504 aa18.48■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcnj14Q8JZN3 434 aa18.48■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Desi2Q9D291 194 aa18.48■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zbtb43Q9DAI4 467 aa18.48■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ItpripQ3TNL8 555 aa18.47■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nlrp9aQ66X03 949 aa18.47■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plekhd1B2RPU2 505 aa18.47■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Panx2Q6IMP4 677 aa18.47■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Map10Q8BJS7 891 aa18.47■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ms4a1P19437 291 aa18.47■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Necab1Q8BG18 352 aa18.47■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q8BT18 775 aa18.47■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ImmtQ8CAQ8 757 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 9230110C19RikQ8CC70 267 aa18.47■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Popdc2Q9ES82 367 aa18.47■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Col14a1Q80X19 1797 aa18.47■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ces1hD3Z298 562 aa18.46■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HdgfP51859 237 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atp1a2Q6PIE5 1020 aa18.46■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Etf1Q8BWY3 437 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kiaa1524Q8BWY9 907 aa18.46■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klhl30Q8C3F7 581 aa18.46■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Appbp2Q9DAX9 585 aa18.46■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vps16Q920Q4 839 aa18.46■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Robo1O89026 1612 aa18.46■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cops6O88545 324 aa18.46■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mei1Q9D4I2 1268 aa18.46■□□□□ 0.55
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp597E9Q6S0 419 aa18.45■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pald1P70261 859 aa18.45■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sptlc3Q8BG54 563 aa18.45■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Efcc1Q9JJF6 558 aa18.45■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem109Q3UBX0 243 aa18.45■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam102bQ8BQS4 339 aa18.45■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pik3ap1Q9EQ32 811 aa18.45■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 IcoslgQ9JHJ8 322 aa18.45■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zeb2Q9R0G7 1215 aa18.45■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Clca2Q8BG22 942 aa18.45■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc12Q8R344 166 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp19a1P28649 503 aa18.44■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ssfa2Q922B9 1252 aa18.44■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AatfQ9JKX4 526 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Col4a1P02463 1669 aa18.44■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa18.44■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bin2D3Z6Q9 489 aa18.44■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm20425E9Q035 978 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SrprbP47758 269 aa18.44■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Itga6Q61739 1091 aa18.44■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nop2Q922K7 793 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znhit6Q3UFB2 460 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcdhb9E9Q5G2 828 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NapbP28663 298 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cplx2P84086 134 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gtpbp6Q3U6U5 514 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hspa4Q61316 841 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ctdspl2Q8BG15 465 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Morc2aQ69ZX6 1030 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Clic6Q8BHB9 596 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zc3h6Q8BYK8 1177 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ces1dQ8VCT4 565 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Eaf2Q91ZD6 262 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SelenooQ9DBC0 667 aa18.43■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Wdr64Q9D565 1086 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zcchc17Q9ESX4 241 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ChmQ9QXG2 665 aa18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 1328.7 ms