Protein–RNA interactions for Protein: P70195

Psmb7, Proteasome subunit beta type-7, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb7P70195 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
Psmb7P70195 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Psmb7P70195 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Psmb7P70195 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Psmb7P70195 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Psmb7P70195 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Psmb7P70195 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Psmb7P70195 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Psmb7P70195 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Psmb7P70195 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Psmb7P70195 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Psmb7P70195 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Psmb7P70195 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Psmb7P70195 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Psmb7P70195 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Psmb7P70195 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Psmb7P70195 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Psmb7P70195 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Psmb7P70195 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Psmb7P70195 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Psmb7P70195 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Psmb7P70195 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Psmb7P70195 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Psmb7P70195 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Psmb7P70195 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Psmb7P70195 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Psmb7P70195 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Psmb7P70195 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Psmb7P70195 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Psmb7P70195 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Psmb7P70195 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Psmb7P70195 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Psmb7P70195 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Psmb7P70195 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Psmb7P70195 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Psmb7P70195 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Psmb7P70195 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Psmb7P70195 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Psmb7P70195 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Psmb7P70195 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Psmb7P70195 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Psmb7P70195 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Psmb7P70195 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Psmb7P70195 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Psmb7P70195 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Psmb7P70195 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Psmb7P70195 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Psmb7P70195 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Psmb7P70195 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Psmb7P70195 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Psmb7P70195 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Psmb7P70195 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Psmb7P70195 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Psmb7P70195 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Psmb7P70195 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Psmb7P70195 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Psmb7P70195 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Psmb7P70195 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Psmb7P70195 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Psmb7P70195 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Psmb7P70195 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Psmb7P70195 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Psmb7P70195 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Psmb7P70195 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Psmb7P70195 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Psmb7P70195 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Psmb7P70195 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Psmb7P70195 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Psmb7P70195 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Psmb7P70195 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Psmb7P70195 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Psmb7P70195 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Psmb7P70195 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Psmb7P70195 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Psmb7P70195 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Psmb7P70195 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Psmb7P70195 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Psmb7P70195 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Psmb7P70195 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Psmb7P70195 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Psmb7P70195 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Psmb7P70195 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Psmb7P70195 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Psmb7P70195 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Psmb7P70195 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Psmb7P70195 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Psmb7P70195 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Psmb7P70195 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Psmb7P70195 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Psmb7P70195 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Psmb7P70195 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Psmb7P70195 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Psmb7P70195 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Psmb7P70195 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Psmb7P70195 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Psmb7P70195 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Psmb7P70195 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Psmb7P70195 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Psmb7P70195 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Psmb7P70195 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms