Protein–RNA interactions for Protein: O88513

Gmnn, Geminin, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmnnO88513 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
GmnnO88513 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
GmnnO88513 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
GmnnO88513 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
GmnnO88513 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
GmnnO88513 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
GmnnO88513 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
GmnnO88513 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
GmnnO88513 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
GmnnO88513 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GmnnO88513 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GmnnO88513 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GmnnO88513 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GmnnO88513 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
GmnnO88513 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.79■■■■□ 3
GmnnO88513 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
GmnnO88513 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GmnnO88513 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GmnnO88513 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GmnnO88513 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GmnnO88513 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GmnnO88513 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GmnnO88513 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
GmnnO88513 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
GmnnO88513 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GmnnO88513 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GmnnO88513 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GmnnO88513 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
GmnnO88513 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
GmnnO88513 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GmnnO88513 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GmnnO88513 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GmnnO88513 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GmnnO88513 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GmnnO88513 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
GmnnO88513 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
GmnnO88513 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GmnnO88513 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GmnnO88513 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GmnnO88513 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GmnnO88513 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GmnnO88513 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GmnnO88513 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GmnnO88513 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GmnnO88513 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
GmnnO88513 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GmnnO88513 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GmnnO88513 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GmnnO88513 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
GmnnO88513 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GmnnO88513 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GmnnO88513 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GmnnO88513 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GmnnO88513 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GmnnO88513 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GmnnO88513 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GmnnO88513 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GmnnO88513 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GmnnO88513 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GmnnO88513 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
GmnnO88513 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
GmnnO88513 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GmnnO88513 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
GmnnO88513 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GmnnO88513 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GmnnO88513 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GmnnO88513 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GmnnO88513 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GmnnO88513 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GmnnO88513 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GmnnO88513 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GmnnO88513 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
GmnnO88513 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GmnnO88513 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GmnnO88513 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GmnnO88513 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GmnnO88513 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GmnnO88513 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GmnnO88513 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GmnnO88513 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GmnnO88513 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GmnnO88513 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GmnnO88513 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GmnnO88513 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GmnnO88513 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GmnnO88513 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GmnnO88513 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GmnnO88513 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GmnnO88513 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GmnnO88513 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GmnnO88513 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GmnnO88513 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GmnnO88513 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GmnnO88513 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GmnnO88513 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GmnnO88513 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GmnnO88513 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
GmnnO88513 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GmnnO88513 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GmnnO88513 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.9 ms