RNA–Protein interactions for RNA: YOR224C

RPB8, Transcript of RNA polymerase subunit ABC14.5, yeast

Gene RPB8, Length 441 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPB8	YOR224C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPB8	YOR224C	BEM4	P39011	633 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPB8	YOR224C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPB8	YOR224C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPB8	YOR224C	FHN1	P53279	174 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPB8	YOR224C	DOS2	P54858	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPB8	YOR224C	ECM9	Q02202	377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPB8	YOR224C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	NTH1	P32356	751 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	COS111	P38308	924 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	BIT61	P47041	543 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	RFX1	P48743	811 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	SPC98	P53540	846 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	FUB1	P25659	250 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	PPZ2	P33329	710 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	DID4	P36108	232 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	YEN1	P40028	759 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	MPS3	P47069	682 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	YGR151C	P53287	111 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	YPS7	Q06325	596 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	GMH1	P36125	273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	BDH2	P39713	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	GPG1	P53130	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	YGL081W	P53156	320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	NMA2	P53204	395 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	PPN1	Q04119	674 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	YFT2	Q06676	274 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	SWI6	P09959	803 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	SPO11	P23179	398 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	TSR4	P25040	408 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	APL3	P38065	1025 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	KCC4	P25389	1037 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	OAF3	P36023	863 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	SET3	P36124	751 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	CTP1	P38152	299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	YHR033W	P38690	423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	HXT7	P39004	570 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	YIL166C	P40445	542 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	TAH11	P47112	604 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
RPB8	YOR224C	KHA1	P40309	873 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	BUD8	P41698	603 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	TAF4	P50105	388 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	DIP5	P53388	608 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	HFI1	Q12060	488 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	INO80	P53115	1489 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	DGR2	P32330	852 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	PEX2	P32800	271 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	ELF1	P36053	145 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	FAT1	P38225	669 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	UBP12	P39538	1254 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	PEA2	P40091	420 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	VID28	P40547	921 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	STP4	Q07351	490 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	TAF3	Q12297	353 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	RMP1	Q12530	201 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPB8	YOR224C	LAM4	P38800	1345 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPB8	YOR224C	SPO1	P53541	631 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPB8	YOR224C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPB8	YOR224C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPB8	YOR224C	RPN13	O13563	156 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPB8	YOR224C	IME1	P21190	360 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPB8	YOR224C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPB8	YOR224C	DAL3	P32459	195 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPB8	YOR224C	SEC6	P32844	805 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPB8	YOR224C	UBS1	P38290	277 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPB8	YOR224C	TMN3	P40071	706 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPB8	YOR224C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPB8	YOR224C	TRE2	Q08693	809 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPB8	YOR224C	SUT2	Q12286	268 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPB8	YOR224C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPB8	YOR224C	STE12	P13574	688 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPB8	YOR224C	YPT7	P32939	208 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPB8	YOR224C	PPE1	P38796	400 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPB8	YOR224C	PMT6	P42934	759 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPB8	YOR224C	SPC105	P53148	917 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPB8	YOR224C	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPB8	YOR224C	PRE4	P30657	266 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPB8	YOR224C	EUG1	P32474	517 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPB8	YOR224C	GRX4	P32642	244 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPB8	YOR224C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPB8	YOR224C	THI6	P41835	540 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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