RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	GSY1	P23337	708 aa		5.29	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	KAE1	P36132	386 aa		5.29	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	VPS45	P38932	577 aa		5.29	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	GAA1	P39012	614 aa		5.29	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	KIN4	Q01919	800 aa		5.29	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	CSM3	Q04659	317 aa		5.29	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	SKG3	Q06315	1026 aa		5.29	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	ATG23	Q06671	453 aa		5.29	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	NTG2	Q08214	380 aa		5.29	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	PCL8	Q08966	492 aa		5.29	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	TUP1	P16649	713 aa		5.28	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	LIP5	P32875	414 aa		5.28	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	YKL222C	P35995	705 aa		5.28	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	UGA2	P38067	497 aa		5.28	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	YBL028C	P38202	106 aa		5.28	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	RGD1	P38339	666 aa		5.28	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	PIH1	P38768	344 aa		5.28	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	MBP1	P39678	833 aa		5.28	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	UBP5	P39944	805 aa		5.28	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	HUL4	P40985	892 aa		5.28	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	HNT2	P49775	206 aa		5.28	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	TAD1	P53065	400 aa		5.28	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	MAL13	P53338	473 aa		5.28	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.28	□□□□□ -1.56	not detected
TRS33	YOR115C	UGO1	Q03327	502 aa		5.28	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	SOV1	Q04748	898 aa		5.28	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	YLH47	Q06493	454 aa		5.28	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	GIN4	Q12263	1142 aa		5.28	□□□□□ -1.56
TRS33	YOR115C	TUS1	Q06412	1307 aa		5.27	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	QCR6	P00127	147 aa		5.27	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	CKA2	P19454	339 aa		5.27	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	ADP1	P25371	1049 aa		5.27	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	ARE1	P25628	610 aa		5.27	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	XRS2	P33301	854 aa		5.27	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	YKL107W	P34251	309 aa		5.27	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	STV1	P37296	890 aa		5.27	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	CST26	P38226	397 aa		5.27	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	PAN5	P38787	379 aa		5.27	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	VPS41	P38959	992 aa		5.27	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	BUD16	P39988	312 aa		5.27	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.27	□□□□□ -1.57	not detected
TRS33	YOR115C	YGL176C	P46945	554 aa		5.27	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	MTC3	P53077	123 aa		5.27	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	NGL3	Q03210	505 aa		5.27	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	LAP2	Q10740	671 aa		5.27	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	SMC6	Q12749	1114 aa		5.27	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	GSC2	P40989	1895 aa		5.26	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	DAL7	P21826	554 aa		5.26	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	RPC53	P25441	422 aa		5.26	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	MSH1	P25846	959 aa		5.26	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	SRB4	P32569	687 aa		5.26	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	YEL043W	P32618	956 aa		5.26	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	SUL1	P38359	859 aa		5.26	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	GDH3	P39708	457 aa		5.26	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	NEO1	P40527	1151 aa		5.26	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	MMM1	P41800	426 aa		5.26	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	ALR2	P43553	858 aa		5.26	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	MIC19	P43594	170 aa		5.26	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	PGA2	P53903	129 aa		5.26	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	MRS2	Q01926	470 aa		5.26	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	SFH1	Q06168	426 aa		5.26	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	YDL057W	Q07379	328 aa		5.26	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	SIL1	Q08199	421 aa		5.26	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	GNT1	Q12096	491 aa		5.26	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	YLR122C	Q12312	125 aa		5.26	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	HBN1	Q96VH4	193 aa		5.26	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	CKI1	P20485	582 aa		5.25	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	RAD53	P22216	821 aa		5.25	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	DEP1	P31385	405 aa		5.25	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	ALG3	P38179	458 aa		5.25	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	SIP3	P38717	1229 aa		5.25	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	VPS4	P52917	437 aa		5.25	□□□□□ -1.57
TRS33	YOR115C	SPO71	Q03868	1245 aa		5.25	□□□□□ -1.57

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