RNA–Protein interactions for RNA: YOL033W

MSE1, Transcript of Mitochondrial glutamyl-tRNA synthetase, yeast

Gene MSE1, Length 1,611 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSE1	YOL033W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	SYO1	Q07395	620 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	THI13	Q07748	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	PET122	P10355	254 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	OM45	P16547	393 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	SFL1	P20134	766 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	SRM1	P21827	482 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	RAD53	P22216	821 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	DOA4	P32571	926 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	UBP11	P36026	717 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	SIP3	P38717	1229 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	SMF2	P38778	549 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
MSE1	YOL033W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	CNN1	P43618	361 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	COG2	P53271	262 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	YNR065C	P53751	1116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	ESBP6	P53918	673 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	UBX4	P54730	416 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	INA17	Q02888	182 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	YMR187C	Q03236	431 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	EAF1	Q06337	982 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	AHC1	Q12433	566 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	PEP7	P32609	515 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	TED1	P40533	473 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	GYP8	P43570	497 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	VPS53	P47061	822 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	MDE1	P47095	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	YML6	P51998	286 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	NUT1	P53114	1132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	MON1	P53129	644 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	SSL2	Q00578	843 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	HOT1	Q03213	719 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	VPS36	Q06696	566 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	TUS1	Q06412	1307 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	SPO16	P17122	198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	NPR1	P22211	790 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	IMP2'	P32351	346 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	LYP1	P32487	611 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	PXL1	P36166	706 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	YBR138C	P38277	524 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	RRM3	P38766	723 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	PAN5	P38787	379 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	SPO22	P40511	975 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	STB4	P50104	949 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	YNL146W	P53906	100 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	BET4	Q00618	327 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	YPL109C	Q02981	657 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	VPS16	Q03308	798 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	YCS4	Q06156	1176 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	SEC10	Q06245	871 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	REH1	Q06709	432 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	APL4	Q12028	832 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	VIK1	Q12045	647 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSE1	YOL033W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	CDC16	P09798	840 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	DMC1	P25453	334 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	MSH1	P25846	959 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	SKN7	P38889	622 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	VPS45	P38932	577 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	BDH2	P39713	417 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	YTA12	P40341	825 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	PCI8	P40512	444 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	VID28	P40547	921 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	LSB6	P42951	607 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSE1	YOL033W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64

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