RNA–Protein interactions for RNA: YBR257W

POP4, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP4, Length 840 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP4	YBR257W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
POP4	YBR257W	ATG11	Q12527	1178 aa		5.25	□□□□□ -1.57
POP4	YBR257W	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
POP4	YBR257W	DAL5	P15365	543 aa		5.24	□□□□□ -1.57
POP4	YBR257W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
POP4	YBR257W	YAP3	P38749	330 aa		5.24	□□□□□ -1.57
POP4	YBR257W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
POP4	YBR257W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
POP4	YBR257W	SSL2	Q00578	843 aa		5.24	□□□□□ -1.57
POP4	YBR257W	FLC1	Q08967	793 aa		5.24	□□□□□ -1.57
POP4	YBR257W	CDC43	P18898	376 aa		5.23	□□□□□ -1.57
POP4	YBR257W	PER1	P25625	357 aa		5.23	□□□□□ -1.57
POP4	YBR257W	SPC29	P33419	253 aa		5.23	□□□□□ -1.57
POP4	YBR257W	YBR259W	P38338	688 aa		5.23	□□□□□ -1.57
POP4	YBR257W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.23	□□□□□ -1.57	not detected
POP4	YBR257W	YJL206C	P39529	758 aa		5.23	□□□□□ -1.57
POP4	YBR257W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
POP4	YBR257W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
POP4	YBR257W	MTL1	P53214	551 aa		5.23	□□□□□ -1.57
POP4	YBR257W	COQ11	Q05892	277 aa		5.23	□□□□□ -1.57
POP4	YBR257W	THI22	Q06490	572 aa		5.23	□□□□□ -1.57
POP4	YBR257W	RKM3	P38222	552 aa		5.22	□□□□□ -1.57
POP4	YBR257W	FMO1	P38866	432 aa		5.22	□□□□□ -1.57
POP4	YBR257W	YIL166C	P40445	542 aa		5.22	□□□□□ -1.57
POP4	YBR257W	CAN1	P04817	590 aa		5.21	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	HUL5	P53119	910 aa		5.21	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	RSC1	P53236	928 aa		5.21	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	YDR514C	Q04408	483 aa		5.21	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	YOL098C	Q12496	1037 aa		5.21	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		5.21	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	APC1	P53886	1748 aa		5.2	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	PSK1	P31374	1356 aa		5.2	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.2	□□□□□ -1.58	not detected
POP4	YBR257W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	PRD1	P25375	712 aa		5.2	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	YHR112C	P38716	378 aa		5.2	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	ECM1	P39715	212 aa		5.2	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	NDC80	P40460	691 aa		5.2	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	HUL4	P40985	892 aa		5.2	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	SMC3	P47037	1230 aa		5.2	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	COG8	Q04632	607 aa		5.2	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	GAD1	Q04792	585 aa		5.2	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	THI7	Q05998	598 aa		5.2	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	NUP145	P49687	1317 aa		5.2	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	DIF1	O13577	133 aa		5.19	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	RAD26	P40352	1085 aa		5.19	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	SHR5	P41912	237 aa		5.19	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	CIR1	P42940	261 aa		5.19	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	SFB3	P38810	929 aa		5.18	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	BDH2	P39713	417 aa		5.18	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	TPM2	P40414	161 aa		5.18	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	FHN1	P53279	174 aa		5.18	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		5.18	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	YLR149C	Q99296	730 aa		5.18	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	RAD50	P12753	1312 aa		5.18	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	DMC1	P25453	334 aa		5.17	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	RPN12	P32496	274 aa		5.17	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	TCD1	P38756	429 aa		5.17	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	NPA3	P47122	385 aa		5.17	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	YAP1802	P53309	568 aa		5.17	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	RTT109	Q07794	436 aa		5.17	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	RAD9	P14737	1309 aa		5.17	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	LYS2	P07702	1392 aa		5.16	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	CIN4	P39110	191 aa		5.16	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	ALY2	P47029	1046 aa		5.16	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	MAL11	P53048	616 aa		5.16	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	HST1	P53685	503 aa		5.16	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	MLH3	Q12083	715 aa		5.16	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		5.16	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	AUS1	Q08409	1394 aa		5.16	□□□□□ -1.58
POP4	YBR257W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
POP4	YBR257W	YEL020C	P39994	560 aa		5.15	□□□□□ -1.59
POP4	YBR257W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
POP4	YBR257W	MDG1	P53885	366 aa		5.15	□□□□□ -1.59
POP4	YBR257W	ARG5,6	Q01217	863 aa		5.15	□□□□□ -1.59
POP4	YBR257W	TAP42	Q04372	366 aa		5.15	□□□□□ -1.59
POP4	YBR257W	LTV1	P34078	463 aa		5.14	□□□□□ -1.59
POP4	YBR257W	PHO11	P35842	467 aa		5.14	□□□□□ -1.59
POP4	YBR257W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
POP4	YBR257W	MIC60	P36112	540 aa		5.14	□□□□□ -1.59
POP4	YBR257W	PHO12	P38693	467 aa		5.14	□□□□□ -1.59
POP4	YBR257W	REV7	P38927	245 aa		5.14	□□□□□ -1.59
POP4	YBR257W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
POP4	YBR257W	GET2	P40056	285 aa		5.14	□□□□□ -1.59
POP4	YBR257W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
POP4	YBR257W	YJL049W	P47048	450 aa		5.14	□□□□□ -1.59
POP4	YBR257W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 114.8 ms