RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520396.1

THUMPD3-AS1-211, THUMPD3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene THUMPD3-AS1, Length 550 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 ITSN2Q9NZM3 1697 aa6.3□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 UNCXA6NJT0 531 aa6.3□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 TREHO43280 583 aa6.3□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 ADH7P40394 386 aa6.3□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 PLAURQ03405 335 aa6.3□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 PCSK7Q16549 785 aa6.3□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.3□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 BTBD6Q96KE9 485 aa6.3□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.3□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.3□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 SLC6A14Q9UN76 642 aa6.3□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa6.3□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 PLA2R1Q13018 1463 aa6.29□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 PLCH2O75038 1416 aa6.29□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 PSAPP07602 524 aa6.29□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 PIP4K2BP78356 416 aa6.29□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.29□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 TTC16Q8NEE8 873 aa6.29□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.29□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 PMEPA1Q969W9 287 aa6.29□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 NAGPAQ9UK23 515 aa6.29□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa6.28□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 IGSF3O75054 1194 aa6.28□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 ALAS2P22557 587 aa6.28□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 SIK1P57059 783 aa6.28□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 CHSY3Q70JA7 882 aa6.28□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 SVOPQ8N4V2 548 aa6.28□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.28□□□□□ -1.4
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa6.27□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 EREGO14944 169 aa6.27□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 NEFLP07196 543 aa6.27□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 MAP3K10Q02779 954 aa6.27□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.27□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 KANK3Q6NY19 840 aa6.27□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 AFAP1Q8N556 730 aa6.27□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 CEP120Q8N960 986 aa6.27□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 TTC9Q92623 222 aa6.27□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.27□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 IGFLR1Q9H665 355 aa6.27□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.27□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 ENAMQ9NRM1 1142 aa6.27□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.27□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 SHANK2Q9UPX8 1470 aa6.27□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 NPATQ14207 1427 aa6.26□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 PHACTR2O75167 634 aa6.26□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 CES1P23141 567 aa6.26□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 DGKGP49619 791 aa6.26□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 PLCB3Q01970 1234 aa6.26□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 HYAL2Q12891 473 aa6.26□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 ORC1Q13415 861 aa6.26□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 COL19A1Q14993 1142 aa6.26□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 PERM1Q5SV97 790 aa6.26□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 MICALL1Q8N3F8 863 aa6.26□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 TMC1Q8TDI8 760 aa6.26□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 LPIN3Q9BQK8 851 aa6.26□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 PTPRKQ15262 1439 aa6.25□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 CPS1P31327 1500 aa6.25□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa6.25□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 ANKRD33BA6NCL7 494 aa6.25□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.25□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 J3QW42 95 aa6.25□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 NFKBIEO00221 500 aa6.25□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 ALBP02768 609 aa6.25□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 ERCC3P19447 782 aa6.25□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 GRIK5Q16478 980 aa6.25□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.25□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.25□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 FAM35AQ86V20 835 aa6.25□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.25□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 GALNT12Q8IXK2 581 aa6.25□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 CSRNP1Q96S65 589 aa6.25□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 ADAMTS8Q9UP79 889 aa6.25□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa6.25□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 MLH3Q9UHC1 1453 aa6.25□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 ABCC1P33527 1531 aa6.25□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 PLXNC1O60486 1568 aa6.24□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 CPB1P15086 417 aa6.24□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa6.24□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.24□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.24□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 PREX2Q70Z35 1606 aa6.24□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 LRRC7Q96NW7 1537 aa6.24□□□□□ -1.41
THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 ZMYM3Q14202 1370 aa6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms