RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 NPR1P16066 1061 aa8.74□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC93Q567U6 631 aa8.74□□□□□ -1.01
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HOXD8-202ENST00000429017 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP8.74□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 WASF2Q9Y6W5 498 aa8.74□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 ABCC12Q96J65 1359 aa8.74□□□□□ -1.01
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HOXD8-202ENST00000429017 COL4A5P29400 1685 aa8.73□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa8.73□□□□□ -1.01
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HOXD8-202ENST00000429017 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
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HOXD8-202ENST00000429017 LAMB4A4D0S4 1761 aa8.72□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 FOXN1O15353 648 aa8.72□□□□□ -1.01
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HOXD8-202ENST00000429017 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.72□□□□□ -1.01
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HOXD8-202ENST00000429017 NGEFQ8N5V2 710 aa8.72□□□□□ -1.01
HOXD8-202ENST00000429017 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
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HOXD8-202ENST00000429017 ZNF652Q9Y2D9 606 aa8.72□□□□□ -1.01
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HOXD8-202ENST00000429017 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
HOXD8-202ENST00000429017 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.71□□□□□ -1.02
HOXD8-202ENST00000429017 RNF123Q5XPI4 1314 aa8.71□□□□□ -1.02
HOXD8-202ENST00000429017 UBN2Q6ZU65 1347 aa8.71□□□□□ -1.02
HOXD8-202ENST00000429017 IQCA1LA6NCM1 817 aa8.7□□□□□ -1.02
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HOXD8-202ENST00000429017 TIMP2P16035 220 aa8.69□□□□□ -1.02
HOXD8-202ENST00000429017 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
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HOXD8-202ENST00000429017 RIC1Q4ADV7 1423 aa8.68□□□□□ -1.02
HOXD8-202ENST00000429017 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.67□□□□□ -1.02
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HOXD8-202ENST00000429017 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
HOXD8-202ENST00000429017 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.66□□□□□ -1.02
HOXD8-202ENST00000429017 PRDM10Q9NQV6 1147 aa8.66□□□□□ -1.02
HOXD8-202ENST00000429017 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.66□□□□□ -1.02
HOXD8-202ENST00000429017 GJA3Q9Y6H8 435 aa8.66□□□□□ -1.02
HOXD8-202ENST00000429017 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
HOXD8-202ENST00000429017 ANXA1P04083 346 aa8.65□□□□□ -1.02
HOXD8-202ENST00000429017 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
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HOXD8-202ENST00000429017 PROSER3Q2NL68 480 aa8.65□□□□□ -1.02
HOXD8-202ENST00000429017 DEFB115Q30KQ5 88 aa8.65□□□□□ -1.02
HOXD8-202ENST00000429017 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
HOXD8-202ENST00000429017 KIF6Q6ZMV9 814 aa8.65□□□□□ -1.02
HOXD8-202ENST00000429017 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
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