RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580081.1

CLTC-212, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 4

Gene CLTC, Length 575 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-212ENST00000580081 CACNG2Q9Y698 323 aa7.37□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 TANC2Q9HCD6 1990 aa7.37□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 ROS1P08922 2347 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 RELNP78509 3460 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 TRAV24A0A0B4J272 114 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 UBE2QL1A1L167 161 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 MEIS3P1A6NDR6 274 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 RFPL4AA6NLU0 287 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 OR2AT4A6NND4 320 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 POM121CA8CG34 1229 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 TMEM178BH3BS89 294 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 H7C1Q1 480 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 LGALS8O00214 317 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 SIRPB1O00241 398 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 CLDN1O95832 211 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 SOD3P08294 240 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 AKAIN1P0CW23 69 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 PSG2P11465 335 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 NAT1P18440 290 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 CD80P33681 288 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 PDCD1Q15116 288 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 MICBQ29980 383 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 TRIM16LQ309B1 348 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 ACTBL2Q562R1 376 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 TEX36Q5VZQ5 186 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 HOGA1Q86XE5 327 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 NEK7Q8TDX7 302 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 RDH5Q92781 318 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 CACNG6Q9BXT2 260 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 DLL4Q9NR61 685 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 TMEM106BQ9NUM4 274 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 ETAA1Q9NY74 926 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 TREM2Q9NZC2 230 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 OR14J1Q9UGF5 321 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa7.36□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 LRRK2Q5S007 2527 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 OOEPA6NGQ2 149 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 FSTL3O95633 263 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 NAPSAO96009 420 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 HPXP02790 462 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 CD74P04233 296 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 FCGR3AP08637 254 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 AMY2BP19961 511 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 PRDX2P32119 198 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 TAS2R46P59540 309 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 MEF2DQ14814 521 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 OXA1LQ15070 435 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 KCNJ8Q15842 424 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 HFEQ30201 348 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 STUMQ69YW2 141 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 STEAP1BQ6NZ63 245 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 DCDC5Q6ZRR9 648 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 BEST4Q8NFU0 473 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 ANGPTL6Q8NI99 470 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 PPP1R35Q8TAP8 253 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 ENKURQ8TC29 256 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 CCL17Q92583 94 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 DNTTIP1Q9H147 329 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 HRASLSQ9HDD0 168 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 ZNF222Q9UK12 451 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 LAMP3Q9UQV4 416 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 ABCA4P78363 2273 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 PKDREJQ9NTG1 2253 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 ICE1Q9Y2F5 2266 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 CACNA1DQ01668 2161 aa7.35□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 DYSFO75923 2080 aa7.34□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa7.34□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 PPIAL4EA0A075B759 164 aa7.34□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa7.34□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa7.34□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 A1L4Q6 167 aa7.34□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 NKX6-3A6NJ46 265 aa7.34□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 PPIAL4DF5H284 164 aa7.34□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 HSPB6O14558 160 aa7.34□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 RAB3DO95716 219 aa7.34□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 MT-ND4P03905 459 aa7.34□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 CD3DP04234 171 aa7.34□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 CSN2P05814 226 aa7.34□□□□□ -1.23
CLTC-212ENST00000580081 PPIAL4FP0DN26 164 aa7.34□□□□□ -1.23
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