RNA–Protein interactions for RNA: YLR368W

MDM30, Transcript of F-box component of an SCF ubiquitin protein ligase complex, yeast

Gene MDM30, Length 1,797 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MDM30	YLR368W	PAN5	P38787	379 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	HIS6	P40545	261 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	GYP8	P43570	497 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	IRC6	P43615	237 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	ABM1	P47146	123 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	RPN14	P53196	417 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	YNL193W	P53870	558 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	TIM10	P87108	93 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	PEX25	Q02969	394 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	ISU1	Q03020	165 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	TAF8	Q03750	510 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
MDM30	YLR368W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	OPI10	Q08202	246 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	FBP1	P09201	348 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	AAC3	P18238	307 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	CBP3	P21560	335 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	VAN1	P23642	535 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	RER1	P25560	188 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	PHO11	P35842	467 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	YKL069W	P36088	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	PHO12	P38693	467 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	YFL034W	P43564	1073 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	CGR1	P53188	120 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	YNR068C	P53754	272 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	LCD1	Q04377	747 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	UFO1	Q04511	668 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	DON1	Q05610	365 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	RRT8	Q08219	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	MDY2	Q12285	212 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	JIP3	O13555	125 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	STE6	P12866	1290 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	CYC8	P14922	966 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	MET8	P15807	274 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	SED4	P25365	1065 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	PRD1	P25375	712 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	ALG3	P38179	458 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	MTG2	P38860	518 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	OSW5	P40219	148 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	SNX4	P47057	423 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	TOF2	Q02208	771 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	TIM50	Q02776	476 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	BDS1	Q08347	646 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	SLP1	Q12232	587 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	FRE6	Q12473	712 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	LAM4	P38800	1345 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM30	YLR368W	BIK1	P11709	440 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
MDM30	YLR368W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	FUN30	P31380	1131 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	SPC29	P33419	253 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	NTH2	P35172	780 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	SMF2	P38778	549 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	YJL068C	P40363	299 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	RSM25	P40496	264 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	TOM22	P49334	152 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	RSC4	Q02206	625 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	UGO1	Q03327	502 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	DFG5	Q05031	458 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	YML133C	Q03099	1374 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	SGS1	P35187	1447 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	CCP1	P00431	361 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	ARG82	P07250	355 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	CDC42	P19073	191 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	DAL7	P21826	554 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	NPL6	P32832	435 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68

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