RNA–Protein interactions for RNA: YLR117C

CLF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene CLF1, Length 2,064 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLF1	YLR117C	MDV1	P47025	714 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	PIB2	P53191	635 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	YGR016W	P53209	190 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	YNL108C	P53929	270 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	UBP2	Q01476	1272 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	ECI1	Q05871	280 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	YDL114W	Q07530	308 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	ATG29	Q12092	213 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	SEY1	Q99287	776 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	POL3	P15436	1097 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	DIT2	P21595	489 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	PEX1	P24004	1043 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	CLB3	P24870	427 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	OCA4	P25366	362 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	SUV3	P32580	737 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	YME1	P32795	747 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	STE5	P32917	917 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	YHR112C	P38716	378 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	SWD1	P39706	426 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	YML020W	Q03722	664 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	ACL4	Q03771	387 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	YLR031W	Q07978	186 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	DAS2	Q12084	232 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	EMP46	Q12396	444 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	ADR1	P07248	1323 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	CLN3	P13365	580 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	PEP3	P27801	918 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	SLA1	P32790	1244 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	TFC4	P33339	1025 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	HES1	P35843	434 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	BCD1	P38772	366 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	ULI1	P43604	169 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	YJL171C	P46992	396 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	APS3	P47064	194 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	ALT1	P52893	592 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	LSC2	P53312	427 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	OSH6	Q02201	448 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	FCP1	Q03254	732 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	ABZ2	Q03266	374 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	RRN11	Q04712	507 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	MNL2	Q12205	849 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	ZRT2	Q12436	422 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	ARP6	Q12509	438 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	YIL177C	P40434	1758 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	YJL225C	P40889	1758 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	GPA2	P10823	449 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	SAS3	P34218	831 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	PPS1	P38148	807 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	YBR032W	P38223	100 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	DYS1	P38791	387 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	CCT6	P39079	546 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	SER3	P40054	469 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	TMN3	P40071	706 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	SER33	P40510	469 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	PAC11	P40960	533 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	LYS14	P40971	790 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	ATG36	P46983	293 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	GLO2	Q05584	274 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	GAS4	Q08271	471 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	SAM3	Q08986	587 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	CEX1	Q12453	761 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	RED1	P14291	827 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	SLM4	P38247	162 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	STN1	P38960	494 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	RPC17	P47076	161 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLF1	YLR117C	MDE1	P47095	244 aa		4.96	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.9 ms