RNA–Protein interactions for RNA: YKR079C

TRZ1, Transcript of tRNA 3'-end processing endonuclease tRNase Z, yeast

Gene TRZ1, Length 2,517 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRZ1	YKR079C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	3.23	□□□□□ -1.89
TRZ1	YKR079C	ARG5,6	Q01217	863 aa		3.23	□□□□□ -1.89
TRZ1	YKR079C	NRG1	Q03125	231 aa		3.23	□□□□□ -1.89
TRZ1	YKR079C	KCC4	P25389	1037 aa		3.23	□□□□□ -1.89
TRZ1	YKR079C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	3.23	□□□□□ -1.89
TRZ1	YKR079C	DPB3	P27344	201 aa		3.23	□□□□□ -1.89
TRZ1	YKR079C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
TRZ1	YKR079C	VID28	P40547	921 aa		3.23	□□□□□ -1.89
TRZ1	YKR079C	REC102	Q02721	264 aa		3.23	□□□□□ -1.89
TRZ1	YKR079C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
TRZ1	YKR079C	YLR407W	Q06070	228 aa		3.23	□□□□□ -1.89
TRZ1	YKR079C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
TRZ1	YKR079C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
TRZ1	YKR079C	DUN1	P39009	513 aa		3.22	□□□□□ -1.89
TRZ1	YKR079C	PLB1	P39105	664 aa		3.22	□□□□□ -1.89
TRZ1	YKR079C	EXG2	P52911	562 aa		3.22	□□□□□ -1.89
TRZ1	YKR079C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
TRZ1	YKR079C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
TRZ1	YKR079C	CDA2	Q06703	312 aa		3.22	□□□□□ -1.89
TRZ1	YKR079C	ENB1	Q08299	606 aa		3.22	□□□□□ -1.89
TRZ1	YKR079C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
TRZ1	YKR079C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
TRZ1	YKR079C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
TRZ1	YKR079C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
TRZ1	YKR079C	STE11	P23561	717 aa		3.22	□□□□□ -1.89
TRZ1	YKR079C	PET127	P32606	800 aa		3.22	□□□□□ -1.89
TRZ1	YKR079C	IES1	P43579	692 aa		3.22	□□□□□ -1.89
TRZ1	YKR079C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
TRZ1	YKR079C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
TRZ1	YKR079C	SGO1	Q08490	590 aa		3.22	□□□□□ -1.89
TRZ1	YKR079C	GAL1	P04385	528 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.21	□□□□□ -1.9	not detected
TRZ1	YKR079C	KAR4	P25583	335 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	SEG2	P34250	1132 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	RPP1	P38786	293 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	ATG16	Q03818	150 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	PPN1	Q04119	674 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	GAD1	Q04792	585 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	VHS3	Q08438	674 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	ATG11	Q12527	1178 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	HXT4	P32467	576 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	CTF13	P35203	478 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	NSE5	Q03718	556 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	PSF3	Q12146	194 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	PIF1	P07271	859 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	CDC26	P14724	124 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	PTH2	P34222	208 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	FUI1	P38196	639 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	TMA10	Q06177	86 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	TGL5	Q12043	749 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	ATP12	P22135	325 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	DGR2	P32330	852 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	SAW1	P39735	261 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	COX18	P53239	316 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	YPS7	Q06325	596 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	OMS1	Q06668	471 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	INO80	P53115	1489 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.19	□□□□□ -1.9	not detected
TRZ1	YKR079C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	YHR112C	P38716	378 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	SPO1	P53541	631 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	STP4	Q07351	490 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	PHO3	P24031	467 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	TOD6	P34219	525 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	SDS22	P36047	338 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	FKH2	P41813	862 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	IRC5	P43610	853 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	YLR358C	O13565	187 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	MET3	P08536	511 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	PHO81	P17442	1178 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	HOP1	P20050	605 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	IME1	P21190	360 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	LST4	P34239	828 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	STL1	P39932	569 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	IES5	P40060	125 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	PXA1	P41909	870 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	TAF4	P50105	388 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	VPS5	Q92331	675 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TRZ1	YKR079C	KIN82	P25341	720 aa		3.18	□□□□□ -1.9

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.5 ms