RNA–Protein interactions for RNA: YKR063C

LAS1, Transcript of Protein required for pre-rRNA processing at both ends of ITS2, yeast

Gene LAS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LAS1	YKR063C	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	NPR3	P38742	1146 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	GSM1	P42950	618 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	GDE1	Q02979	1223 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	RAD61	Q99359	647 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	ACE2	P21192	770 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	MAK31	P23059	88 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	VPS8	P39702	1274 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	YER130C	P39959	443 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	VID27	P40157	782 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	YGL176C	P46945	554 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	YPT11	P48559	417 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	KIN4	Q01919	800 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	CEX1	Q12453	761 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	GPA1	P08539	472 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	RXT2	P38255	430 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	GEM1	P39722	662 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	RXT3	Q07458	294 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	FLO1	P32768	1537 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	PES4	P39684	611 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	EAF6	P47128	113 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	HFM1	P51979	1187 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	YGR053C	P53234	283 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	HDA1	P53973	706 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	RKM4	Q12504	494 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	YOR111W	Q99210	232 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	CIT1	P00890	479 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	CDC6	P09119	513 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	YKL107W	P34251	309 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	CSM2	P40465	213 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	PCI8	P40512	444 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	RTC4	P53850	401 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	SIZ1	Q04195	904 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	CRF1	Q04930	467 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	DCS2	Q12123	353 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	TIP41	Q12199	356 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	TOP1	P04786	769 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	SHC1	P39000	512 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	GCV2	P49095	1034 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	MTC3	P53077	123 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	MSC2	Q03455	724 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	XYL2	Q07993	356 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	GPB1	Q08886	897 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	PCL8	Q08966	492 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LAS1	YKR063C	PRE8	P23639	250 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LAS1	YKR063C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
LAS1	YKR063C	GSY2	P27472	705 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LAS1	YKR063C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
LAS1	YKR063C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
LAS1	YKR063C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
LAS1	YKR063C	SAS3	P34218	831 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LAS1	YKR063C	YKL151C	P36059	337 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LAS1	YKR063C	SSL2	Q00578	843 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LAS1	YKR063C	SPO20	Q04359	397 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LAS1	YKR063C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
LAS1	YKR063C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
LAS1	YKR063C	ALG1	P16661	449 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LAS1	YKR063C	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
LAS1	YKR063C	MSM1	P22438	575 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LAS1	YKR063C	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
LAS1	YKR063C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
LAS1	YKR063C	MSS4	P38994	779 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LAS1	YKR063C	TPM2	P40414	161 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LAS1	YKR063C	YGL138C	P53122	345 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LAS1	YKR063C	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
LAS1	YKR063C	FOL1	P53848	824 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LAS1	YKR063C	TIM50	Q02776	476 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LAS1	YKR063C	VPS30	Q02948	557 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LAS1	YKR063C	MMR1	Q06324	491 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LAS1	YKR063C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66

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