RNA–Protein interactions for RNA: YKL086W

SRX1, Transcript of Sulfiredoxin, yeast

Gene SRX1, Length 384 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SRX1	YKL086W	COQ8	P27697	501 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	YAP5	P40574	245 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	MMM1	P41800	426 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	STR2	P47164	639 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	MND1	P53102	219 aa		18.43	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	SPE1	P08432	466 aa		18.42	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	YER152C	P10356	443 aa		18.42	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	HXT8	P40886	569 aa		18.42	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	PDE1	P22434	369 aa		18.41	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	PEP7	P32609	515 aa		18.41	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	BFA1	P47113	574 aa		18.41	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	SPO12	P17123	173 aa		18.4	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	EXO5	P38289	585 aa		18.4	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	VPS25	P47142	202 aa		18.4	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	YNL011C	P53980	444 aa		18.4	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	TRE1	Q08919	783 aa		18.4	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	DAP1	Q12091	152 aa		18.4	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	YOL098C	Q12496	1037 aa		18.4	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	YMC2	P38087	329 aa		18.39	■□□□□ 0.53
SRX1	YKL086W	PEX28	P38848	579 aa		18.39	■□□□□ 0.53
SRX1	YKL086W	OPY2	Q06810	360 aa		18.39	■□□□□ 0.53
SRX1	YKL086W	JIP3	O13555	125 aa		18.38	■□□□□ 0.53
SRX1	YKL086W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
SRX1	YKL086W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
SRX1	YKL086W	YBR056W	P38081	501 aa		18.38	■□□□□ 0.53
SRX1	YKL086W	SAF1	P38352	637 aa		18.38	■□□□□ 0.53
SRX1	YKL086W	MOB1	P40484	314 aa		18.38	■□□□□ 0.53
SRX1	YKL086W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
SRX1	YKL086W	PHO86	P46956	311 aa		18.38	■□□□□ 0.53
SRX1	YKL086W	MCM2	P29469	868 aa		18.37	■□□□□ 0.53
SRX1	YKL086W	MET4	P32389	672 aa		18.37	■□□□□ 0.53
SRX1	YKL086W	SIF2	P38262	535 aa		18.37	■□□□□ 0.53
SRX1	YKL086W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
SRX1	YKL086W	GYP6	P32806	458 aa		18.36	■□□□□ 0.53
SRX1	YKL086W	YTA12	P40341	825 aa		18.36	■□□□□ 0.53
SRX1	YKL086W	YJL045W	P47052	634 aa		18.36	■□□□□ 0.53
SRX1	YKL086W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	18.36	■□□□□ 0.53
SRX1	YKL086W	HMG2	P12684	1045 aa		18.35	■□□□□ 0.53
SRX1	YKL086W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
SRX1	YKL086W	RDH54	P38086	958 aa		18.35	■□□□□ 0.53
SRX1	YKL086W	RAD55	P38953	406 aa		18.35	■□□□□ 0.53
SRX1	YKL086W	ATG3	P40344	310 aa		18.35	■□□□□ 0.53
SRX1	YKL086W	SLG1	P54867	378 aa		18.35	■□□□□ 0.53
SRX1	YKL086W	APL4	Q12028	832 aa		18.35	■□□□□ 0.53
SRX1	YKL086W	PFD1	P46988	109 aa		18.34	■□□□□ 0.53
SRX1	YKL086W	HOP2	P53187	214 aa		18.34	■□□□□ 0.53
SRX1	YKL086W	ARO80	Q04052	950 aa		18.34	■□□□□ 0.53
SRX1	YKL086W	CCH1	P50077	2039 aa		18.33	■□□□□ 0.53
SRX1	YKL086W	APE1	P14904	514 aa		18.33	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	YEL075C	P39972	122 aa		18.33	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	ERG5	P54781	538 aa		18.33	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	MDM38	Q08179	573 aa		18.33	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	VPS54	Q12071	889 aa		18.33	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	NBP2	Q12163	236 aa		18.33	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	RRN6	P32786	894 aa		18.32	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	YKL050C	P35736	922 aa		18.32	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	CDC27	P38042	758 aa		18.32	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	ASG7	P46993	209 aa		18.32	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	HER2	Q03557	464 aa		18.32	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	DDC1	Q08949	612 aa		18.32	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	YBL036C	P38197	257 aa		18.31	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	RIM4	P38741	713 aa		18.31	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	YCG1	Q06680	1035 aa		18.31	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	MTF2	P10849	440 aa		18.3	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	SPC110	P32380	944 aa		18.3	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	GUF1	P46943	645 aa		18.3	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	SAM3	Q08986	587 aa		18.3	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	RRD2	Q12461	358 aa		18.3	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	VPS38	Q05919	439 aa		18.29	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	FMP25	Q08023	583 aa		18.29	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	PEX34	P25584	144 aa		18.28	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	TDA3	P38758	523 aa		18.28	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	CDC1	P40986	491 aa		18.28	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	VTC4	P47075	721 aa		18.28	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	PUS2	P53167	370 aa		18.28	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	SGO1	Q08490	590 aa		18.28	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	APC5	Q08683	685 aa		18.28	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	MRP4	P32902	394 aa		18.27	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	YKR051W	P36142	418 aa		18.27	■□□□□ 0.52
SRX1	YKL086W	GCN5	Q03330	439 aa		18.27	■□□□□ 0.52

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