RNA–Protein interactions for RNA: YJL038C

LOH1, Transcript of Protein involved in outer spore wall assembly, yeast

Gene LOH1, Length 660 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LOH1	YJL038C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	RXT2	P38255	430 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	GEM1	P39722	662 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	RNH70	P53331	553 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	TIM50	Q02776	476 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	SVF1	Q05515	481 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	GRX6	Q12438	231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	BI4	P03879	638 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	CTT1	P06115	562 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
LOH1	YJL038C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	DUT1	P33317	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	TAT2	P38967	592 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
LOH1	YJL038C	YGL176C	P46945	554 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	EEB1	Q02891	456 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	GDE1	Q02979	1223 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	RXT3	Q07458	294 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	FLO11	P08640	1367 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	MNR2	P35724	969 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	PSY4	P38193	441 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	VPS8	P39702	1274 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	ALG2	P43636	503 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	WAR1	Q03631	944 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	DUS4	Q06063	367 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	GPB1	Q08886	897 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	TOM20	P35180	183 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	PNT1	P38969	423 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	LYS14	P40971	790 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	OSW7	P43611	510 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	GCV2	P49095	1034 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	YGL138C	P53122	345 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	SPO20	Q04359	397 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	MMR1	Q06324	491 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	PSR2	Q07949	397 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	DSE3	Q08729	430 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	RKM4	Q12504	494 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LOH1	YJL038C	CIT1	P00890	479 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	NUC1	P08466	329 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	PRE8	P23639	250 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	TSR4	P25040	408 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	CDC15	P27636	974 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	CHS3	P29465	1165 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	SLA2	P33338	968 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	YKL107W	P34251	309 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	ASE1	P50275	885 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	MTC3	P53077	123 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	FOL1	P53848	824 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	MDM1	Q01846	1127 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	VPS30	Q02948	557 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	TMA16	Q08687	178 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	AFT2	Q08957	416 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	PCL8	Q08966	492 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	CDC20	P26309	610 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	CTS1	P29029	562 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	DOM34	P33309	386 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	MNN4	P36044	1178 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	YGR237C	P50089	785 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	HFM1	P51979	1187 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	MSC2	Q03455	724 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	SUE1	Q06524	206 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	UBX5	Q06682	500 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	CEX1	Q12453	761 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	ALG1	P16661	449 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	STV1	P37296	890 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LOH1	YJL038C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64

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