RNA–Protein interactions for RNA: YFR049W

YMR31, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeastyeast

Gene YMR31, Length 372 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR31YFR049W YEL076CP39971 216 aa3.08□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W IES1P43579 692 aa3.08□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W SET2P46995 733 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W MAD3P47074 515 aa3.08□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W EXG2P52911 562 aa3.08□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W TRS130Q03660 1102 aa3.08□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W HLR1Q04429 423 aa3.08□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W ASM4Q05166 528 aa3.08□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W WHI4Q07655 649 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W VHS3Q08438 674 aa3.08□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W PSF3Q12146 194 aa3.08□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W RRI2Q12348 645 aa3.08□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W RIB2Q12362 591 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W SPE1P08432 466 aa3.07□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W NUC1P08466 329 aa3.07□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W CDC26P14724 124 aa3.07□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W CBP3P21560 335 aa3.07□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W SED4P25365 1065 aa3.07□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W RER1P25560 188 aa3.07□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W SHM2P37291 469 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W YHR033WP38690 423 aa3.07□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W SDP1P40479 209 aa3.07□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W MND2P40577 368 aa3.07□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W SMK1P41808 388 aa3.07□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W IRC5P43610 853 aa3.07□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W GTF1P53260 183 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W ESF2P53743 316 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W MTD1Q02046 320 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W YPS7Q06325 596 aa3.07□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W OPY2Q06810 360 aa3.07□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W SGO1Q08490 590 aa3.07□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W YOR352WQ08816 343 aa3.07□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W YDR056CQ12025 205 aa3.07□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W ENT1Q12518 454 aa3.07□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W CYC1P00044 109 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W GAL10P04397 699 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W VAS1P07806 1104 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W FBP1P09201 348 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W ADH4P10127 382 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W GFA1P14742 717 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W NGG1P32494 702 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W SLC1P33333 303 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W ATG19P35193 415 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W LRG1P35688 1017 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W CTF8P38877 133 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W SWD1P39706 426 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W NDE1P40215 560 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W RAD26P40352 1085 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W PSF2P40359 213 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W VHR1P40522 640 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W FAF1P40546 346 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W PFA3P42836 336 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W ENP2P48234 707 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W GCV2P49095 1034 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W PRP31P49704 494 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W COX18P53239 316 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W MDG1P53885 366 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W NSG2P53898 299 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W YMR187CQ03236 431 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W SIZ1Q04195 904 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W CIA1Q05583 330 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W TSR2Q06672 205 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W SWM1Q12379 170 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W GCD1P09032 578 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W PYC1P11154 1178 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W SEG2P34250 1132 aa3.05□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W RRN3P36070 627 aa3.05□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W TAF5P38129 798 aa3.05□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W SPC72P39723 622 aa3.05□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W KAP123P40069 1113 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W MDR1P53258 950 aa3.05□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W YGR130CP53278 816 aa3.05□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W MEP3P53390 489 aa3.05□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W SQS1P53866 767 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W MRPL13Q02204 264 aa3.05□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W PKH1Q03407 766 aa3.05□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W ROT1Q03691 256 aa3.05□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W URN1Q06525 465 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W TPO1Q07824 586 aa3.05□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W YDR215CQ12240 137 aa3.05□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W CLF1Q12309 687 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W PHO5P00635 467 aa3.04□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W HSC82P15108 705 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W POL3P15436 1097 aa3.04□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W FRS1P15624 595 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W YCK2P23292 546 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W CLB4P24871 460 aa3.04□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W MF(ALPHA)2P32435 120 aa3.04□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W KAE1P36132 386 aa3.04□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W APT2P36973 181 aa3.04□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W MSS4P38994 779 aa3.04□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W YNL195CP40168 261 aa3.04□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W IMA5P40884 581 aa3.04□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W YFL066CP43538 392 aa3.04□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W TAF4P50105 388 aa3.04□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W VBA4Q04602 768 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W STP4Q07351 490 aa3.04□□□□□ -1.92
YMR31YFR049W MCA1Q08601 432 aa3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 87.5 ms