RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C LCD1Q04377 747 aa3.12□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C VMR1P38735 1592 aa3.12□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C GCN2P15442 1659 aa3.11□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C PDR5P33302 1511 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C STE5P32917 917 aa3.11□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C REC104P33323 182 aa3.11□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C PBY1P38254 753 aa3.11□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C ASM4Q05166 528 aa3.11□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C IML1P47170 1584 aa3.11□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C SIR3P06701 978 aa3.1□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C PYC1P11154 1178 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C CCR4P31384 837 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C TYS1P36421 394 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C SIC1P38634 284 aa3.1□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C BAP3P41815 604 aa3.1□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C TGL5Q12043 749 aa3.1□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C HAL9Q12180 1030 aa3.1□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C HIR1P32479 840 aa3.09□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C HBS1P32769 611 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C PFA3P42836 336 aa3.09□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C MAK10Q02197 733 aa3.09□□□□□ -1.91
GCN4YEL009C PDR11P40550 1411 aa3.09□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C UBS1P38290 277 aa3.08□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C PAF1P38351 445 aa3.08□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C IRR1P40541 1150 aa3.08□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C YKL033W-AQ86ZR7 236 aa3.08□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C HAP1P0CE41 1502 aa3.08□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C NUP1P20676 1076 aa3.07□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C RPA135P22138 1203 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C CYS3P31373 394 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C YBR284WP38150 797 aa3.07□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C MUP3P38734 546 aa3.07□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C SAK1P38990 1142 aa3.07□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C VAC8P39968 578 aa3.07□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C SSY5P47002 699 aa3.07□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C NOP7P53261 605 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C NOG2P53742 486 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C ENV7Q12003 364 aa3.07□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C YPR071WQ12346 211 aa3.07□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C RAV1P47104 1357 aa3.07□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C PRP9P19736 530 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C NAP1P25293 417 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C YBR184WP38299 523 aa3.06□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C SPF1P39986 1215 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C ATG4P53867 494 aa3.06□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C ALD6P54115 500 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C GPR1Q12361 961 aa3.06□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C RTC1Q08281 1341 aa3.05□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C APN1P22936 367 aa3.05□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C YBR259WP38338 688 aa3.05□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C ECM1P39715 212 aa3.05□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C PFD1P46988 109 aa3.05□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C TDA5Q06417 326 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C THI21Q08975 551 aa3.05□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C CDC11P32458 415 aa3.04□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C CCT3P39077 534 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C CCT4P39078 528 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C ULP2P40537 1034 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C ALR2P43553 858 aa3.04□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data3.04□□□□□ -1.92not detected
GCN4YEL009C TEX1P53851 422 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C STP1Q00947 519 aa3.04□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C FMP30Q02883 468 aa3.04□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C YOR022CQ12204 715 aa3.04□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C PET10P36139 283 aa3.03□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C GAD1Q04792 585 aa3.03□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C RSC3Q06639 885 aa3.03□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C UBX5Q06682 500 aa3.03□□□□□ -1.92
GCN4YEL009C BCK1Q01389 1478 aa3.03□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C KRE5P22023 1365 aa3.02□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C NUP192P47054 1683 aa3.02□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C MSD1P15179 658 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C NIT3P49954 291 aa3.02□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C FMP25Q08023 583 aa3.02□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C USO1P25386 1790 aa3.02□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C RAD9P14737 1309 aa3.01□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C PRC1P00729 532 aa3.01□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C TOP3P13099 656 aa3.01□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C DAL7P21826 554 aa3.01□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C KCC4P25389 1037 aa3.01□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C YCL002CP25565 263 aa3.01□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C TAF5P38129 798 aa3.01□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C PSA1P41940 361 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C IRC8P47046 822 aa3.01□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C UTP8P53276 713 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C FHN1P53279 174 aa3.01□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C LRS4Q04087 347 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C HBN1Q96VH4 193 aa3.01□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C ADE5,7P07244 802 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C GRX1P25373 110 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C ESL2P36168 1195 aa3□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C SVF1Q05515 481 aa3□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C GEP3Q08622 556 aa3□□□□□ -1.93
GCN4YEL009C CLF1Q12309 687 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
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