RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeastyeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRD1YCL057W TAF5P38129 798 aa5.6□□□□□ -1.51
PRD1YCL057W YBR071WP38243 211 aa5.6□□□□□ -1.51
PRD1YCL057W AIM3P38266 947 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PRD1YCL057W NIT1P40447 199 aa5.6□□□□□ -1.51
PRD1YCL057W SPT20P50875 604 aa5.6□□□□□ -1.51
PRD1YCL057W PCL10P53124 433 aa5.6□□□□□ -1.51
PRD1YCL057W RIM8P53179 542 aa5.6□□□□□ -1.51
PRD1YCL057W ASI2P53895 289 aa5.6□□□□□ -1.51
PRD1YCL057W MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PRD1YCL057W YLR224WQ05947 369 aa5.6□□□□□ -1.51
PRD1YCL057W DCS2Q12123 353 aa5.6□□□□□ -1.51
PRD1YCL057W NPC2Q12408 173 aa5.6□□□□□ -1.51
PRD1YCL057W LTE1P07866 1435 aa5.6□□□□□ -1.51
PRD1YCL057W PRP4P20053 465 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PRD1YCL057W GAS1P22146 559 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PRD1YCL057W MNN4P36044 1178 aa5.6□□□□□ -1.51
PRD1YCL057W MIP6P38760 659 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PRD1YCL057W MNN11P46985 422 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PRD1YCL057W ARP4P80428 489 aa5.6□□□□□ -1.51
PRD1YCL057W ECM9Q02202 377 aa5.6□□□□□ -1.51
PRD1YCL057W PRP6P19735 899 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PRD1YCL057W SAK1P38990 1142 aa5.59□□□□□ -1.51
PRD1YCL057W PLB1P39105 664 aa5.59□□□□□ -1.51
PRD1YCL057W DUG1P43616 481 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PRD1YCL057W COG6P53959 839 aa5.59□□□□□ -1.51
PRD1YCL057W ASM4Q05166 528 aa5.59□□□□□ -1.51
PRD1YCL057W YSP2Q06681 1438 aa5.59□□□□□ -1.51
PRD1YCL057W MSS4P38994 779 aa5.59□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W PZF1P39933 429 aa5.59□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W PFA3P42836 336 aa5.59□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W NUP157P40064 1391 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W SSZ1P38788 538 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W HXT6P39003 570 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W HXT7P39004 570 aa5.58□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W VPS27P40343 622 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W VHR1P40522 640 aa5.58□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W PRP43P53131 767 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W CDC45Q08032 650 aa5.58□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W MMS1Q06211 1407 aa5.58□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W TDA3P38758 523 aa5.57□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W YJR039WP47107 1121 aa5.57□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W YGR153WP48238 217 aa5.57□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W SWM1Q12379 170 aa5.57□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data5.57□□□□□ -1.52not detected
PRD1YCL057W LST4P34239 828 aa5.57□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W THI80P35202 319 aa5.57□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W DID4P36108 232 aa5.57□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W MTR3P48240 250 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W BRE5P53741 515 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W TRE2Q08693 809 aa5.57□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W DOP1Q03921 1698 aa5.56□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W GPP2P40106 250 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W EXG2P52911 562 aa5.56□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W APM4Q99186 491 aa5.56□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W ELM1P32801 640 aa5.56□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W MAL31P38156 614 aa5.56□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W PEX8P53248 589 aa5.56□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W RGA2Q06407 1009 aa5.56□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W KAR4P25583 335 aa5.55□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W NIT2P47016 307 aa5.55□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W LEE1Q02799 301 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W PEX19Q07418 342 aa5.55□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W HFI1Q12060 488 aa5.55□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W PDR11P40550 1411 aa5.55□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W YLR415CO13578 112 aa5.54□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W TOD6P34219 525 aa5.54□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W SIC1P38634 284 aa5.54□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W GID8P40208 455 aa5.54□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W YDL144CQ07589 356 aa5.54□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W CHC1P22137 1653 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W RPP0P05317 312 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W CTF13P35203 478 aa5.54□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W BEM4P39011 633 aa5.54□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W ATG36P46983 293 aa5.54□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W ERG5P54781 538 aa5.54□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W PKH1Q03407 766 aa5.54□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W LAS17Q12446 633 aa5.54□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W TRM11Q12463 433 aa5.54□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W RTC1Q08281 1341 aa5.54□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W DNF2Q12675 1612 aa5.54□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W RAV1P47104 1357 aa5.54□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W STE11P23561 717 aa5.53□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W RNQ1P25367 405 aa5.53□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W AKL1P38080 1108 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W ORC4P54791 529 aa5.53□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W ENB1Q08299 606 aa5.53□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W SUI2P20459 304 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W AEP2P22136 580 aa5.53□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W DAL3P32459 195 aa5.53□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W NGG1P32494 702 aa5.53□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W OAF3P36023 863 aa5.53□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W DJP1P40564 432 aa5.53□□□□□ -1.52
PRD1YCL057W DRS2P39524 1355 aa5.52□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W SWI6P09959 803 aa5.52□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W ROX1P25042 368 aa5.52□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W PLC1P32383 869 aa5.52□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W RPP1P38786 293 aa5.52□□□□□ -1.53
PRD1YCL057W ECM1P39715 212 aa5.52□□□□□ -1.53
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