RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000185355.6

Ldb1-208, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 2,088 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Spty2d1	Q68FG3	682 aa		32.82	■■■□□ 2.85
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Prl3d1	P18121	224 aa		32.82	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Immt	Q8CAQ8	757 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rufy2	Q8R4C2	606 aa		32.82	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Sytl4	Q9R0Q1	673 aa		32.82	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Spata31d1b	E9QA57	1361 aa		32.81	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Esco1	Q69Z69	843 aa		32.81	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mrpl44	Q9CY73	333 aa	Known RBP	32.81	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Incenp	Q9WU62	880 aa		32.81	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Setdb1	O88974	1307 aa		32.81	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Bin2	D3Z6Q9	489 aa		32.81	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Col3a1	P08121	1464 aa		32.8	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ccdc173	A0JLY1	547 aa		32.8	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Trim34a	Q99PP6	485 aa		32.8	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Plekho1	Q9JIY0	408 aa		32.8	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Chd1l	Q9CXF7	900 aa		32.79	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Wdr33	Q8K4P0	1330 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cgn	P59242	1191 aa		32.79	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	4931408C20Rik	E9PWP9	1381 aa		32.78	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pald1	P70261	859 aa		32.78	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Plekhf1	Q3TB82	279 aa		32.78	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Slf2	Q6P9P0	1278 aa		32.78	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Qtrt2	B8ZXI1	415 aa		32.78	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ermn	Q5EBJ4	281 aa		32.78	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Zbtb22	Q9Z0G7	638 aa		32.78	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gm29094	F6Q785	221 aa		32.77	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Sptlc3	Q8BG54	563 aa		32.77	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Trim59	Q922Y2	403 aa		32.77	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mthfs	Q9D110	203 aa		32.77	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ndufa8	Q9DCJ5	172 aa		32.77	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cyp2d34	L7N463	504 aa		32.76	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Fsd1	Q7TPM6	496 aa		32.76	■■■□□ 2.84
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Snrpa1	P57784	255 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ubash3a	Q3V3E1	624 aa		32.76	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Abtb2	Q7TQI7	1024 aa		32.76	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Olfml1	Q8BSH2	233 aa		32.76	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ttc14	Q9CSP9	761 aa		32.76	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cacna1s	Q02789	1880 aa		32.75	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Edrf1	Q6GQV7	1239 aa		32.75	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Zfp317	Q8C0Q5	607 aa		32.75	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Wdr19	Q3UGF1	1341 aa		32.75	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Susd4	Q8BH32	490 aa		32.74	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Alx1	Q8C8B0	326 aa		32.74	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Shisa4	Q8CA71	197 aa		32.74	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Klc3	Q91W40	508 aa		32.74	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Klhl34	A2AI76	644 aa		32.74	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cct2	P80314	535 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Hand2	Q61039	217 aa		32.73	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pdcl2	Q78Y63	240 aa		32.73	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rrp12	Q6P5B0	1295 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Nme8	Q715T0	586 aa		32.73	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Nxf7	Q80SZ6	620 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Emilin1	Q99K41	1017 aa		32.73	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Speer4d	L7N216	212 aa		32.72	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mcm3	P25206	812 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Kiaa0753	Q6A000	959 aa		32.72	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Miga2	Q8BK03	593 aa		32.72	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Csrnp1	P59054	583 aa		32.71	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rgs9	O54828	675 aa		32.71	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mtmr3	Q8K296	1196 aa		32.71	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cfap73	J3QPZ5	306 aa		32.7	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gm4340	L7N2C4	268 aa		32.7	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Znf326	O88291	580 aa		32.7	■■■□□ 2.83
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pcdhb9	E9Q5G2	828 aa		32.69	■■■□□ 2.82
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ercc3	P49135	783 aa		32.69	■■■□□ 2.82
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cep55	Q8BT07	462 aa		32.69	■■■□□ 2.82
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Gtf2a1	Q99PM3	378 aa		32.69	■■■□□ 2.82
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ccdc162p	Q0VG85	912 aa		32.68	■■■□□ 2.82
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ifit1bl2	Q3U687	466 aa		32.68	■■■□□ 2.82
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Slfnl1	Q8BHW9	410 aa		32.68	■■■□□ 2.82
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Bcl11b	Q99PV8	884 aa		32.68	■■■□□ 2.82
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Scn11a	Q9R053	1765 aa		32.68	■■■□□ 2.82
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Pcdhb22	Q91XZ8	794 aa		32.68	■■■□□ 2.82
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tom1	O88746	492 aa		32.67	■■■□□ 2.82
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Sowahd	Q8BY98	327 aa		32.67	■■■□□ 2.82
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Plch1	Q4KWH5	1682 aa		32.67	■■■□□ 2.82
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Add3	Q9QYB5	706 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cyp2d9	P11714	504 aa		32.66	■■■□□ 2.82
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cep63	Q3UPP8	700 aa		32.66	■■■□□ 2.82
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cnot6l	Q8VEG6	555 aa		32.66	■■■□□ 2.82
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ttc27	Q8CD92	847 aa		32.65	■■■□□ 2.82
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Psrc1	Q9D0P7	329 aa		32.65	■■■□□ 2.82
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Odf2l	Q9D478	642 aa		32.65	■■■□□ 2.82
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Sall1	Q9ER74	1322 aa		32.65	■■■□□ 2.82
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Dctn1	O08788	1281 aa		32.65	■■■□□ 2.82
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Utp3	Q9JI13	469 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Mast3	Q3U214	1321 aa		32.64	■■■□□ 2.82
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Lnx1	O70263	728 aa		32.64	■■■□□ 2.82
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Lins1	Q3U1D0	764 aa		32.64	■■■□□ 2.82
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Fsd2	Q8BZ52	692 aa		32.64	■■■□□ 2.82
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Tnmd	Q9EP64	317 aa		32.64	■■■□□ 2.82
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Rps6ka4	Q9Z2B9	773 aa		32.64	■■■□□ 2.82
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Myh3	P13541	1940 aa		32.64	■■■□□ 2.82
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Usp25	P57080	1055 aa		32.63	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Bicd2	Q921C5	820 aa		32.63	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ush1c	Q9ES64	910 aa		32.63	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Cfap58	B2RW38	873 aa		32.63	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	1700113H08Rik	E9Q9Q5	327 aa		32.63	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Anp32c	Q64G17	123 aa		32.63	■■■□□ 2.81
Ldb1-208	ENSMUST00000185355	Ngdn	Q9DB96	315 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81

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