Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP64

Tnmd, Tenomodulin, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnmdQ9EP64 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
TnmdQ9EP64 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
TnmdQ9EP64 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
TnmdQ9EP64 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
TnmdQ9EP64 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TnmdQ9EP64 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
TnmdQ9EP64 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TnmdQ9EP64 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TnmdQ9EP64 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TnmdQ9EP64 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
TnmdQ9EP64 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TnmdQ9EP64 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TnmdQ9EP64 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TnmdQ9EP64 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
TnmdQ9EP64 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TnmdQ9EP64 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
TnmdQ9EP64 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TnmdQ9EP64 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
TnmdQ9EP64 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
TnmdQ9EP64 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
TnmdQ9EP64 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TnmdQ9EP64 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TnmdQ9EP64 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TnmdQ9EP64 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TnmdQ9EP64 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TnmdQ9EP64 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TnmdQ9EP64 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TnmdQ9EP64 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TnmdQ9EP64 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TnmdQ9EP64 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TnmdQ9EP64 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TnmdQ9EP64 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
TnmdQ9EP64 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TnmdQ9EP64 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TnmdQ9EP64 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TnmdQ9EP64 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
TnmdQ9EP64 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TnmdQ9EP64 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TnmdQ9EP64 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TnmdQ9EP64 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
TnmdQ9EP64 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TnmdQ9EP64 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TnmdQ9EP64 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TnmdQ9EP64 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
TnmdQ9EP64 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TnmdQ9EP64 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TnmdQ9EP64 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TnmdQ9EP64 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TnmdQ9EP64 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TnmdQ9EP64 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TnmdQ9EP64 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TnmdQ9EP64 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
TnmdQ9EP64 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TnmdQ9EP64 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TnmdQ9EP64 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
TnmdQ9EP64 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TnmdQ9EP64 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TnmdQ9EP64 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TnmdQ9EP64 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TnmdQ9EP64 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TnmdQ9EP64 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TnmdQ9EP64 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TnmdQ9EP64 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TnmdQ9EP64 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
TnmdQ9EP64 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TnmdQ9EP64 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TnmdQ9EP64 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TnmdQ9EP64 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TnmdQ9EP64 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TnmdQ9EP64 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TnmdQ9EP64 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TnmdQ9EP64 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TnmdQ9EP64 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TnmdQ9EP64 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TnmdQ9EP64 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TnmdQ9EP64 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TnmdQ9EP64 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TnmdQ9EP64 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TnmdQ9EP64 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TnmdQ9EP64 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TnmdQ9EP64 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TnmdQ9EP64 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TnmdQ9EP64 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TnmdQ9EP64 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TnmdQ9EP64 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
TnmdQ9EP64 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TnmdQ9EP64 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TnmdQ9EP64 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TnmdQ9EP64 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
TnmdQ9EP64 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TnmdQ9EP64 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TnmdQ9EP64 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TnmdQ9EP64 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TnmdQ9EP64 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TnmdQ9EP64 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TnmdQ9EP64 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TnmdQ9EP64 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TnmdQ9EP64 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TnmdQ9EP64 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TnmdQ9EP64 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms