Protein–RNA interactions for Protein: Q99K41

Emilin1, EMILIN-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emilin1Q99K41 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC50.79■■■■■ 5.72
Emilin1Q99K41 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.18
Emilin1Q99K41 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.54■■■■■ 5.04
Emilin1Q99K41 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC44.46■■■■■ 4.71
Emilin1Q99K41 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC43.5■■■■■ 4.55
Emilin1Q99K41 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
Emilin1Q99K41 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
Emilin1Q99K41 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
Emilin1Q99K41 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
Emilin1Q99K41 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
Emilin1Q99K41 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
Emilin1Q99K41 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
Emilin1Q99K41 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Emilin1Q99K41 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
Emilin1Q99K41 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC41.32■■■■■ 4.21
Emilin1Q99K41 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Emilin1Q99K41 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Emilin1Q99K41 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Emilin1Q99K41 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Emilin1Q99K41 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
Emilin1Q99K41 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
Emilin1Q99K41 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Emilin1Q99K41 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Emilin1Q99K41 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Emilin1Q99K41 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
Emilin1Q99K41 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Emilin1Q99K41 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Emilin1Q99K41 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Emilin1Q99K41 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Emilin1Q99K41 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
Emilin1Q99K41 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Emilin1Q99K41 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Emilin1Q99K41 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Emilin1Q99K41 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Emilin1Q99K41 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Emilin1Q99K41 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
Emilin1Q99K41 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Emilin1Q99K41 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
Emilin1Q99K41 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Emilin1Q99K41 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Emilin1Q99K41 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Emilin1Q99K41 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
Emilin1Q99K41 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Emilin1Q99K41 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Emilin1Q99K41 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
Emilin1Q99K41 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Emilin1Q99K41 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Emilin1Q99K41 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Emilin1Q99K41 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
Emilin1Q99K41 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Emilin1Q99K41 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
Emilin1Q99K41 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Emilin1Q99K41 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
Emilin1Q99K41 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Emilin1Q99K41 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Emilin1Q99K41 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Emilin1Q99K41 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Emilin1Q99K41 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
Emilin1Q99K41 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Emilin1Q99K41 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Emilin1Q99K41 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Emilin1Q99K41 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Emilin1Q99K41 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Emilin1Q99K41 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Emilin1Q99K41 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Emilin1Q99K41 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Emilin1Q99K41 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Emilin1Q99K41 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Emilin1Q99K41 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Emilin1Q99K41 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Emilin1Q99K41 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Emilin1Q99K41 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Emilin1Q99K41 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Emilin1Q99K41 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Emilin1Q99K41 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Emilin1Q99K41 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Emilin1Q99K41 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Emilin1Q99K41 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Emilin1Q99K41 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Emilin1Q99K41 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Emilin1Q99K41 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Emilin1Q99K41 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Emilin1Q99K41 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Emilin1Q99K41 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Emilin1Q99K41 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Emilin1Q99K41 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Emilin1Q99K41 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Emilin1Q99K41 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Emilin1Q99K41 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Emilin1Q99K41 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Emilin1Q99K41 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Emilin1Q99K41 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Emilin1Q99K41 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Emilin1Q99K41 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Emilin1Q99K41 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Emilin1Q99K41 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Emilin1Q99K41 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Emilin1Q99K41 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Emilin1Q99K41 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
Emilin1Q99K41 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms