Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM6

Fsd1, Fibronectin type III and SPRY domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fsd1Q7TPM6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.85■■■■■ 4.45
Fsd1Q7TPM6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Fsd1Q7TPM6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Fsd1Q7TPM6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Fsd1Q7TPM6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Fsd1Q7TPM6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Fsd1Q7TPM6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
Fsd1Q7TPM6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Fsd1Q7TPM6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
Fsd1Q7TPM6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
Fsd1Q7TPM6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
Fsd1Q7TPM6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Fsd1Q7TPM6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Fsd1Q7TPM6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Fsd1Q7TPM6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Fsd1Q7TPM6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Fsd1Q7TPM6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Fsd1Q7TPM6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Fsd1Q7TPM6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Fsd1Q7TPM6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Fsd1Q7TPM6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Fsd1Q7TPM6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Fsd1Q7TPM6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Fsd1Q7TPM6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Fsd1Q7TPM6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Fsd1Q7TPM6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Fsd1Q7TPM6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Fsd1Q7TPM6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Fsd1Q7TPM6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Fsd1Q7TPM6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Fsd1Q7TPM6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Fsd1Q7TPM6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
Fsd1Q7TPM6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Fsd1Q7TPM6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Fsd1Q7TPM6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Fsd1Q7TPM6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Fsd1Q7TPM6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Fsd1Q7TPM6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Fsd1Q7TPM6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Fsd1Q7TPM6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Fsd1Q7TPM6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Fsd1Q7TPM6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Fsd1Q7TPM6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Fsd1Q7TPM6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Fsd1Q7TPM6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Fsd1Q7TPM6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Fsd1Q7TPM6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Fsd1Q7TPM6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Fsd1Q7TPM6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Fsd1Q7TPM6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Fsd1Q7TPM6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Fsd1Q7TPM6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Fsd1Q7TPM6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Fsd1Q7TPM6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Fsd1Q7TPM6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Fsd1Q7TPM6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Fsd1Q7TPM6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Fsd1Q7TPM6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Fsd1Q7TPM6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Fsd1Q7TPM6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Fsd1Q7TPM6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Fsd1Q7TPM6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Fsd1Q7TPM6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Fsd1Q7TPM6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Fsd1Q7TPM6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Fsd1Q7TPM6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Fsd1Q7TPM6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Fsd1Q7TPM6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Fsd1Q7TPM6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Fsd1Q7TPM6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Fsd1Q7TPM6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Fsd1Q7TPM6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Fsd1Q7TPM6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Fsd1Q7TPM6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Fsd1Q7TPM6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Fsd1Q7TPM6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Fsd1Q7TPM6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Fsd1Q7TPM6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Fsd1Q7TPM6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Fsd1Q7TPM6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Fsd1Q7TPM6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Fsd1Q7TPM6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Fsd1Q7TPM6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Fsd1Q7TPM6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Fsd1Q7TPM6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Fsd1Q7TPM6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Fsd1Q7TPM6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Fsd1Q7TPM6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Fsd1Q7TPM6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Fsd1Q7TPM6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Fsd1Q7TPM6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Fsd1Q7TPM6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Fsd1Q7TPM6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Fsd1Q7TPM6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Fsd1Q7TPM6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Fsd1Q7TPM6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Fsd1Q7TPM6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Fsd1Q7TPM6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Fsd1Q7TPM6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Fsd1Q7TPM6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms