Protein–RNA interactions for Protein: P18121

Prl3d1, Prolactin-3D1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3d1P18121 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46.04■■■■■ 4.96
Prl3d1P18121 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
Prl3d1P18121 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Prl3d1P18121 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Prl3d1P18121 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
Prl3d1P18121 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.82■■■■□ 3.97
Prl3d1P18121 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Prl3d1P18121 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
Prl3d1P18121 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Prl3d1P18121 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Prl3d1P18121 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Prl3d1P18121 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Prl3d1P18121 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
Prl3d1P18121 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Prl3d1P18121 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Prl3d1P18121 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
Prl3d1P18121 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Prl3d1P18121 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Prl3d1P18121 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Prl3d1P18121 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
Prl3d1P18121 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Prl3d1P18121 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Prl3d1P18121 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Prl3d1P18121 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Prl3d1P18121 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Prl3d1P18121 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Prl3d1P18121 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
Prl3d1P18121 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Prl3d1P18121 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Prl3d1P18121 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Prl3d1P18121 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Prl3d1P18121 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Prl3d1P18121 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Prl3d1P18121 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Prl3d1P18121 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Prl3d1P18121 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Prl3d1P18121 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Prl3d1P18121 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Prl3d1P18121 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Prl3d1P18121 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Prl3d1P18121 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Prl3d1P18121 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Prl3d1P18121 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Prl3d1P18121 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Prl3d1P18121 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Prl3d1P18121 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Prl3d1P18121 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Prl3d1P18121 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Prl3d1P18121 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Prl3d1P18121 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Prl3d1P18121 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Prl3d1P18121 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Prl3d1P18121 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Prl3d1P18121 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Prl3d1P18121 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Prl3d1P18121 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Prl3d1P18121 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Prl3d1P18121 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Prl3d1P18121 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Prl3d1P18121 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Prl3d1P18121 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Prl3d1P18121 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Prl3d1P18121 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Prl3d1P18121 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Prl3d1P18121 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Prl3d1P18121 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Prl3d1P18121 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Prl3d1P18121 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Prl3d1P18121 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Prl3d1P18121 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Prl3d1P18121 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Prl3d1P18121 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Prl3d1P18121 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Prl3d1P18121 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Prl3d1P18121 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Prl3d1P18121 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Prl3d1P18121 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Prl3d1P18121 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Prl3d1P18121 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Prl3d1P18121 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Prl3d1P18121 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Prl3d1P18121 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Prl3d1P18121 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Prl3d1P18121 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Prl3d1P18121 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Prl3d1P18121 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Prl3d1P18121 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Prl3d1P18121 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Prl3d1P18121 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Prl3d1P18121 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Prl3d1P18121 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Prl3d1P18121 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Prl3d1P18121 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Prl3d1P18121 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Prl3d1P18121 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Prl3d1P18121 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Prl3d1P18121 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Prl3d1P18121 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Prl3d1P18121 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Prl3d1P18121 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms