RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W CDC11P32458 415 aa3.21□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W PET112P33893 541 aa3.21□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W TPO2P53283 614 aa3.21□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W SND1Q04007 877 aa3.21□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W GAL11P19659 1081 aa3.21□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W YCL049CP25577 312 aa3.21□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W HXT4P32467 576 aa3.21□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W SEM1O94742 89 aa3.21□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W RPS14AP06367 137 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W WHI2P12611 486 aa3.21□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W UBC1P21734 215 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W RPS14BP39516 138 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W ERV46P39727 415 aa3.21□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W QRI1P43123 477 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W HSV2P50079 448 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W YGR273CP53329 174 aa3.21□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W SLX4Q12098 748 aa3.21□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W RPS0AP32905 252 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W QDR1P40475 563 aa3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W DAS1P47005 663 aa3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W AAD4Q07747 329 aa3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W RNA1P11745 407 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W CDC26P14724 124 aa3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W YJU3P28321 313 aa3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W THI4P32318 326 aa3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W MDJ2P42834 146 aa3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W ELP2P42935 788 aa3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W TIM54P47045 478 aa3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W NUT2Q06213 157 aa3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W PIN2Q12057 282 aa3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W PSY3Q12318 242 aa3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W SBP1P10080 294 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W PHO8P11491 566 aa3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W ATG15P25641 520 aa3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W GUT2P32191 649 aa3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W TCA17P32613 152 aa3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data3.2□□□□□ -1.9not detected
SIN3YOL004W CIC1P38779 376 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W ORC6P38826 435 aa3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W YEN1P40028 759 aa3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W SPP1Q03012 353 aa3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W RPN4Q03465 531 aa3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W RGR1P19263 1082 aa3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W RPB10P22139 70 aa3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W CHS3P29465 1165 aa3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W YNR063WP53749 607 aa3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W SPC19Q03954 165 aa3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W NKP1Q12493 238 aa3.2□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W MDM35O60200 86 aa3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W TEF1P02994 458 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W VMA4P22203 233 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W SEC6P32844 805 aa3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W VBA5P36172 582 aa3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W AKL1P38080 1108 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W KEL1P38853 1164 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W DAK2P43550 591 aa3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W TGL2P54857 326 aa3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W RNT1Q02555 471 aa3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W VPS16Q03308 798 aa3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W STE20Q03497 939 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W YHM2Q04013 314 aa3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W TKL1P23254 680 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W SPT16P32558 1035 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W SGE1P33335 543 aa3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W SAS3P34218 831 aa3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W KAE1P36132 386 aa3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W AFG3P39925 761 aa3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W NUP82P40368 713 aa3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W YJR030CP47101 745 aa3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W ITC1P53125 1264 aa3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W TDA5Q06417 326 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W GUD1Q07729 489 aa3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W SAC3P46674 1301 aa3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W MST1P07236 462 aa3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W TUB3P09734 445 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W SCJ1P25303 377 aa3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W PEP12P32854 288 aa3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W REG2P38232 338 aa3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data3.19□□□□□ -1.9not detected
SIN3YOL004W GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W DIC1Q06143 298 aa3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W YPQ2Q06328 317 aa3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W RAD61Q99359 647 aa3.19□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W PTH2P34222 208 aa3.18□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W RRP3P38712 501 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W THI73Q07904 523 aa3.18□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W NCR1Q12200 1170 aa3.18□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W SLX5P32828 619 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W ATG19P35193 415 aa3.18□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W YAP1801P38856 637 aa3.18□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W ALT1P52893 592 aa3.18□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W TAN1P53072 289 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W COG4Q06096 861 aa3.18□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
SIN3YOL004W SPO75Q07798 868 aa3.18□□□□□ -1.9
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