RNA–Protein interactions for RNA: YKL063C

YKL063C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKL063C, Length 504 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL063C	YKL063C	YJL049W	P47048	450 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	TEL2	P53038	688 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	RIA1	P53893	1110 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	GAD1	Q04792	585 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	SGO1	Q08490	590 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	FMO1	P38866	432 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.01	□□□□□ -1.77	not detected
YKL063C	YKL063C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	CDC9	P04819	755 aa		4	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	MCD4	P36051	919 aa		4	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	UBS1	P38290	277 aa		4	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	YBR259W	P38338	688 aa		4	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	BAP3	P41815	604 aa		4	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.99	□□□□□ -1.77	not detected
YKL063C	YKL063C	MIH1	P23748	554 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	MEF1	P25039	761 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	EMP70	P32802	667 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	MTC2	P34246	357 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	YKR051W	P36142	418 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	SSL2	Q00578	843 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	MDM10	P18409	493 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	CDC43	P18898	376 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.98	□□□□□ -1.77	not detected
YKL063C	YKL063C	YJL206C	P39529	758 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	YFL052W	P43551	465 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	YBP2	P53169	641 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	YOL098C	Q12496	1037 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	DSS1	P39112	969 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	GET2	P40056	285 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	YNL195C	P40168	261 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	NPY1	P53164	384 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	MLH3	Q12083	715 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YKL063C	YKL063C	VBA3	P25594	458 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	PHO11	P35842	467 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	PHO12	P38693	467 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	ARG5,6	Q01217	863 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	YOR131C	Q12486	218 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	SCT1	P32784	759 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	REV7	P38927	245 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	NUP60	P39705	539 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	NDC80	P40460	691 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	BNA2	P47125	453 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	NNF1	P47149	201 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	ORC4	P54791	529 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	ARP4	P80428	489 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	ATG11	Q12527	1178 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	SIR3	P06701	978 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	ADY2	P25613	283 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	USV1	Q12132	391 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	TAF3	Q12297	353 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	NDJ1	Q12366	352 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	ECM3	Q99252	613 aa		3.94	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	3.93	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	3.93	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	NUP82	P40368	713 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	BUD6	P41697	788 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	IMO32	P53219	342 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	THI7	Q05998	598 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	ARO10	Q06408	635 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	RAD18	P10862	487 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	SET3	P36124	751 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	3.92	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	ECM1	P39715	212 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	AIM14	P53109	570 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	COX18	P53239	316 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	FHN1	P53279	174 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	MDM12	Q92328	271 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	YIL166C	P40445	542 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	CAF16	P43569	289 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	CTR1	P49573	406 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	RPN4	Q03465	531 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	ZRT2	Q12436	422 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YKL063C	YKL063C	SRD1	P09007	221 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YKL063C	YKL063C	GLG1	P36143	616 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YKL063C	YKL063C	YAP1802	P53309	568 aa		3.9	□□□□□ -1.79

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 95.1 ms