RNA–Protein interactions for RNA: YJL176C

SWI3, Transcript of Subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex, yeast

Gene SWI3, Length 2,478 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SWI3	YJL176C	LEO1	P38439	464 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	STB5	P38699	743 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	APM2	P38700	605 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	NUT1	P53114	1132 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	YPR078C	Q06813	372 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	MNL2	Q12205	849 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	XRS2	P33301	854 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	GCS1	P35197	352 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	KDX1	P36005	433 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	SDS3	P40505	327 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	POL31	P46957	487 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	PPM1	Q04081	328 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	CDC11	P32458	415 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	YIR016W	P40572	265 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	VPS75	P53853	264 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	ESBP6	P53918	673 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	CHS1	P08004	1131 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	SMC1	P32908	1225 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	MIC60	P36112	540 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	AGP2	P38090	596 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	RGD1	P38339	666 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	CCC2	P38995	1004 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	YJR054W	P47114	497 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	HFM1	P51979	1187 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	ADA2	Q02336	434 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	YLR287C	Q05881	355 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	TAF10	Q12030	206 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	ECM3	Q99252	613 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	MAS1	P10507	462 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	PHO13	P19881	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	PGS1	P25578	521 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	RAD27	P26793	382 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	SLA2	P33338	968 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	CSG2	P35206	410 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	YBR284W	P38150	797 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	GEM1	P39722	662 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	VFA1	P40080	203 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	PIG1	Q06216	648 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.96	□□□□□ -1.61
SWI3	YJL176C	TPK1	P06244	397 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	SCJ1	P25303	377 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	DAL2	P25335	343 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	PEX2	P32800	271 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	TAF1	P46677	1066 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	BFA1	P47113	574 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	APM4	Q99186	491 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	LAA1	P39526	2014 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	GAC1	P28006	793 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	FRE1	P32791	686 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	DYS1	P38791	387 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	MAF1	P41910	395 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	UME1	Q03010	460 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	MUB1	Q03162	620 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	VBA3	P25594	458 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	VBA5	P36172	582 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	YHR131C	P38835	850 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	RTT107	P38850	1070 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	TGL3	P40308	642 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	YER152C	P10356	443 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	TUP1	P16649	713 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	CLC1	P17891	233 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	COQ8	P27697	501 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	TKL2	P33315	681 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	PXL1	P36166	706 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	DSE1	P40077	573 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	HXT8	P40886	569 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	ZAP1	P47043	880 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	VPS70	P47161	811 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	PRM6	Q04705	352 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	GPM2	Q12008	311 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SWI3	YJL176C	HMI1	Q12039	706 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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