RNA–Protein interactions for RNA: YHR004C

NEM1, Transcript of Probable catalytic subunit of Nem1p-Spo7p phosphatase holoenzyme, yeast

Gene NEM1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NEM1	YHR004C	GYP8	P43570	497 aa		5.97	□□□□□ -1.45
NEM1	YHR004C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
NEM1	YHR004C	SIR3	P06701	978 aa		5.96	□□□□□ -1.46
NEM1	YHR004C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
NEM1	YHR004C	TMT1	P32643	299 aa		5.96	□□□□□ -1.46
NEM1	YHR004C	ORC2	P32833	620 aa		5.96	□□□□□ -1.46
NEM1	YHR004C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
NEM1	YHR004C	ZIP2	P53061	704 aa		5.96	□□□□□ -1.46
NEM1	YHR004C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
NEM1	YHR004C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
NEM1	YHR004C	GPR1	Q12361	961 aa		5.96	□□□□□ -1.46
NEM1	YHR004C	BDH2	P39713	417 aa		5.95	□□□□□ -1.46
NEM1	YHR004C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
NEM1	YHR004C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
NEM1	YHR004C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		5.95	□□□□□ -1.46
NEM1	YHR004C	DIF1	O13577	133 aa		5.94	□□□□□ -1.46
NEM1	YHR004C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
NEM1	YHR004C	ALG2	P43636	503 aa		5.93	□□□□□ -1.46
NEM1	YHR004C	CIT1	P00890	479 aa		5.92	□□□□□ -1.46
NEM1	YHR004C	EMP70	P32802	667 aa		5.92	□□□□□ -1.46
NEM1	YHR004C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
NEM1	YHR004C	YGR125W	P53273	1036 aa		5.92	□□□□□ -1.46
NEM1	YHR004C	ATP25	Q03153	612 aa		5.92	□□□□□ -1.46
NEM1	YHR004C	SPC29	P33419	253 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NEM1	YHR004C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
NEM1	YHR004C	MET7	Q08645	548 aa		5.91	□□□□□ -1.46
NEM1	YHR004C	RAD4	P14736	754 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NEM1	YHR004C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.47
NEM1	YHR004C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.47
NEM1	YHR004C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.47
NEM1	YHR004C	ATG4	P53867	494 aa		5.9	□□□□□ -1.47
NEM1	YHR004C	APT2	P36973	181 aa		5.89	□□□□□ -1.47
NEM1	YHR004C	SFB3	P38810	929 aa		5.89	□□□□□ -1.47
NEM1	YHR004C	PAC2	P39937	518 aa		5.89	□□□□□ -1.47
NEM1	YHR004C	TAF8	Q03750	510 aa		5.89	□□□□□ -1.47
NEM1	YHR004C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
NEM1	YHR004C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
NEM1	YHR004C	NUP60	P39705	539 aa		5.88	□□□□□ -1.47
NEM1	YHR004C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.87	□□□□□ -1.47	not detected
NEM1	YHR004C	VPS34	P22543	875 aa		5.87	□□□□□ -1.47
NEM1	YHR004C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	5.87	□□□□□ -1.47
NEM1	YHR004C	MTL1	P53214	551 aa		5.87	□□□□□ -1.47
NEM1	YHR004C	ORC4	P54791	529 aa		5.87	□□□□□ -1.47
NEM1	YHR004C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
NEM1	YHR004C	FMO1	P38866	432 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NEM1	YHR004C	TIM54	P47045	478 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NEM1	YHR004C	SEG1	Q04279	960 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NEM1	YHR004C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
NEM1	YHR004C	ALY2	P47029	1046 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NEM1	YHR004C	MRK1	P50873	501 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NEM1	YHR004C	UBS1	P38290	277 aa		5.84	□□□□□ -1.47
NEM1	YHR004C	YHR112C	P38716	378 aa		5.84	□□□□□ -1.47
NEM1	YHR004C	HXT16	P47185	567 aa		5.84	□□□□□ -1.47
NEM1	YHR004C	FHN1	P53279	174 aa		5.84	□□□□□ -1.47
NEM1	YHR004C	MCM21	Q06675	368 aa		5.84	□□□□□ -1.47
NEM1	YHR004C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
NEM1	YHR004C	PHO11	P35842	467 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NEM1	YHR004C	PHO12	P38693	467 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NEM1	YHR004C	ARG5,6	Q01217	863 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NEM1	YHR004C	RIM13	Q03792	727 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NEM1	YHR004C	FLC1	Q08967	793 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NEM1	YHR004C	LYS9	P38999	446 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NEM1	YHR004C	ZRT2	Q12436	422 aa		5.81	□□□□□ -1.48
NEM1	YHR004C	PER1	P25625	357 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NEM1	YHR004C	BET3	P36149	193 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NEM1	YHR004C	MUP3	P38734	546 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NEM1	YHR004C	YJL049W	P47048	450 aa		5.8	□□□□□ -1.48
NEM1	YHR004C	PTP1	P25044	335 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NEM1	YHR004C	GMH1	P36125	273 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NEM1	YHR004C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.79	□□□□□ -1.48	not detected
NEM1	YHR004C	YFL052W	P43551	465 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NEM1	YHR004C	KCC4	P25389	1037 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NEM1	YHR004C	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
NEM1	YHR004C	REC102	Q02721	264 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NEM1	YHR004C	OSW1	Q08692	278 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NEM1	YHR004C	MLH3	Q12083	715 aa		5.78	□□□□□ -1.48
NEM1	YHR004C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NEM1	YHR004C	FUB1	P25659	250 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NEM1	YHR004C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NEM1	YHR004C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NEM1	YHR004C	GAT1	P43574	510 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NEM1	YHR004C	BNA2	P47125	453 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NEM1	YHR004C	USV1	Q12132	391 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NEM1	YHR004C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NEM1	YHR004C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NEM1	YHR004C	LTP1	P40347	161 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NEM1	YHR004C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NEM1	YHR004C	YDR338C	Q05497	695 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NEM1	YHR004C	CAN1	P04817	590 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NEM1	YHR004C	ABF1	P14164	731 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NEM1	YHR004C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
NEM1	YHR004C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
NEM1	YHR004C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
NEM1	YHR004C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
NEM1	YHR004C	GAL11	P19659	1081 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NEM1	YHR004C	TY4A-J	P47023	414 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NEM1	YHR004C	NET1	P47035	1189 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NEM1	YHR004C	NPY1	P53164	384 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NEM1	YHR004C	ERG11	P10614	530 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NEM1	YHR004C	PEX1	P24004	1043 aa		5.73	□□□□□ -1.49

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