RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRD1	YCL057W	GUP2	Q08929	609 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	HMI1	Q12039	706 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	DIF1	O13577	133 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	HMG1	P12683	1054 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	CTF8	P38877	133 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	ECL1	P48235	211 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	AIM14	P53109	570 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	GIN4	Q12263	1142 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	NUP145	P49687	1317 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	IQG1	Q12280	1495 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	TOM20	P35180	183 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	CHA4	P43634	648 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	VPS62	P53285	467 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	PRC1	P00729	532 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	STE14	P32584	239 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	SAP190	P36123	1033 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	SDP1	P40479	209 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	GCV2	P49095	1034 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	GUD1	Q07729	489 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	UPC2	Q12151	913 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	BUD3	P25558	1636 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	HIS5	P07172	385 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	HSL7	P38274	827 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	YJR096W	P47137	282 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	ZIP2	P53061	704 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	PUS2	P53167	370 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	GCN5	Q03330	439 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	NTE1	Q04958	1679 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	CKB2	P38930	258 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	SHR5	P41912	237 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	PDS5	Q04264	1277 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	GPB1	Q08886	897 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	OPY1	P38271	328 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	BNA2	P47125	453 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	NCS6	P53088	359 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	YOR352W	Q08816	343 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	CLC1	P17891	233 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	EMC1	P25574	760 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	MRC1	P25588	1096 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	HFD1	Q04458	532 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	YLR149C	Q99296	730 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	SEG2	P34250	1132 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	MAC1	P35192	417 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	YKR051W	P36142	418 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	CRR1	Q05790	422 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	CDA2	Q06703	312 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	RXT3	Q07458	294 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	GPR1	Q12361	961 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	CDC20	P26309	610 aa		5.65	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	YHR078W	P38799	552 aa		5.65	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	NPY1	P53164	384 aa		5.65	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	YKR018C	P36114	725 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	YAP6	Q03935	383 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	TMA17	Q12513	150 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	PDR12	Q02785	1511 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	SOD2	P00447	233 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	SED4	P25365	1065 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	FLR1	P38124	548 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	SSY5	P47002	699 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	YPL277C	Q08989	487 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	YFL052W	P43551	465 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	FOL1	P53848	824 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	EUG1	P32474	517 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	RET2	P43621	546 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	YJR120W	P47157	116 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	YOR093C	Q12275	1648 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	KCS1	Q12494	1050 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	SPO14	P36126	1683 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PRD1	YCL057W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.9 ms