RNA–Protein interactions for RNA: YBL064C

PRX1, Transcript of Mitochondrial peroxiredoxin with thioredoxin peroxidase activity, yeast

Gene PRX1, Length 786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRX1	YBL064C	NSI1	Q12457	570 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	KTR4	P38131	464 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	MAL31	P38156	614 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	YHL041W	P38730	149 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	HIS6	P40545	261 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	YJR039W	P47107	1121 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	BFA1	P47113	574 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	HSL1	P34244	1518 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	FBP1	P09201	348 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	ZRG8	P40021	1076 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	ARP4	P80428	489 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	SSY1	Q03770	852 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	SWI6	P09959	803 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	ATP12	P22135	325 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	COQ2	P32378	372 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	ERP2	P39704	215 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	PSR2	Q07949	397 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
PRX1	YBL064C	MSS18	P08593	268 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	YKR075C	P36155	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	TAT1	P38085	619 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	EXO84	P38261	753 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	CTF8	P38877	133 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	BEM4	P39011	633 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	ACA1	P39970	489 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
PRX1	YBL064C	SPE1	P08432	466 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	CHS2	P14180	963 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	CMP2	P14747	604 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	PHO81	P17442	1178 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	ADP1	P25371	1049 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	DBF20	P32328	564 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	MND2	P40577	368 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	SAP185	P40856	1058 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	QRI7	P43122	407 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	SSY5	P47002	699 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	HOL1	P53389	586 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	YLR122C	Q12312	125 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	YOL114C	Q12322	202 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PRX1	YBL064C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	YHR078W	P38799	552 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	VID27	P40157	782 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	SDP1	P40479	209 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	VID28	P40547	921 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	OMS1	Q06668	471 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	SWR1	Q05471	1514 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	HOP1	P20050	605 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	SSH4	P32343	579 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	ATG19	P35193	415 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	ORC4	P54791	529 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	YML131W	Q03102	365 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	YLR407W	Q06070	228 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	GAL10	P04397	699 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	CDC26	P14724	124 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	KAE1	P36132	386 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	YHR202W	P38887	602 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	SAK1	P38990	1142 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	YIL092W	P40497	633 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	ASK10	P48361	1146 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	ASM4	Q05166	528 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	COG4	Q06096	861 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	NUR1	Q12066	484 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	GPR1	Q12361	961 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	HIR3	P47171	1648 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	PHO3	P24031	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	HXT4	P32467	576 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	SAW1	P39735	261 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	EAF5	P39995	279 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRX1	YBL064C	YGR130C	P53278	816 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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