RNA–Protein interactions for RNA: YBL009W

ALK2, Transcript of Protein kinase, yeast

Gene ALK2, Length 2,031 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ALK2	YBL009W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
ALK2	YBL009W	LAS17	Q12446	633 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ALK2	YBL009W	KCS1	Q12494	1050 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ALK2	YBL009W	RIM15	P43565	1770 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ALK2	YBL009W	FBP1	P09201	348 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ALK2	YBL009W	YCR015C	P25616	317 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ALK2	YBL009W	CTS1	P29029	562 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ALK2	YBL009W	RPC82	P32349	654 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ALK2	YBL009W	YKL133C	P36066	463 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ALK2	YBL009W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
ALK2	YBL009W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
ALK2	YBL009W	NCS6	P53088	359 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ALK2	YBL009W	DSD1	P53095	428 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ALK2	YBL009W	TPO2	P53283	614 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ALK2	YBL009W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
ALK2	YBL009W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
ALK2	YBL009W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
ALK2	YBL009W	UPC2	Q12151	913 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ALK2	YBL009W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	GAL11	P19659	1081 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	YCL002C	P25565	263 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	HUL4	P40985	892 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	YLR358C	O13565	187 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	PRD1	P25375	712 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	YKR075C	P36155	307 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	GIP4	P39732	760 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	NUP82	P40368	713 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	GDH3	P39708	457 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	CEP3	P40969	608 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	ALG2	P43636	503 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	PHO23	P50947	330 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	YKR011C	Q02209	353 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	THI22	Q06490	572 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	YDL144C	Q07589	356 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	NPC2	Q12408	173 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	NUP145	P49687	1317 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	MPH2	P0CD99	609 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	EMC3	P36039	253 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	NPR2	P39923	615 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	HXT16	P47185	567 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	BUL1	P48524	976 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	EXG2	P52911	562 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	TAD1	P53065	400 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	CTF4	Q01454	927 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	YOR131C	Q12486	218 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.75	□□□□□ -1.97	not detected
ALK2	YBL009W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	DAL7	P21826	554 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	MEF1	P25039	761 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	SPC29	P33419	253 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.75	□□□□□ -1.97	not detected
ALK2	YBL009W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	YNL050C	P53952	270 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	RTT109	Q07794	436 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	HAL9	Q12180	1030 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	STE11	P23561	717 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	KAR4	P25583	335 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	CTF8	P38877	133 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	MSS4	P38994	779 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	EDE1	P34216	1381 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	PHO8	P11491	566 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	PER1	P25625	357 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	DCG1	P32460	244 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	YKL222C	P35995	705 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	SDP1	P40479	209 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	ATP25	Q03153	612 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	MET7	Q08645	548 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	RAD53	P22216	821 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	ATG19	P35193	415 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	YBP2	P53169	641 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	ERG5	P54781	538 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	YOR022C	Q12204	715 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ALK2	YBL009W	GPR1	Q12361	961 aa		2.73	□□□□□ -1.97

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 50 ms