RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545663.5

CLSTN3-216, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 533 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-216ENST00000545663 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
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CLSTN3-216ENST00000545663 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CLSTN3-216ENST00000545663 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CLSTN3-216ENST00000545663 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.56■□□□□ 0.88
CLSTN3-216ENST00000545663 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20.56■□□□□ 0.88
CLSTN3-216ENST00000545663 LAMB2P55268 1798 aa20.55■□□□□ 0.88
CLSTN3-216ENST00000545663 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CLSTN3-216ENST00000545663 SREBF2Q12772 1141 aa20.55■□□□□ 0.88
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CLSTN3-216ENST00000545663 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CLSTN3-216ENST00000545663 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
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CLSTN3-216ENST00000545663 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.5■□□□□ 0.87
CLSTN3-216ENST00000545663 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CLSTN3-216ENST00000545663 TMC4Q7Z404 712 aa20.5■□□□□ 0.87
CLSTN3-216ENST00000545663 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.5■□□□□ 0.87
CLSTN3-216ENST00000545663 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.5■□□□□ 0.87
CLSTN3-216ENST00000545663 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CLSTN3-216ENST00000545663 COL4A1P02462 1669 aa20.5■□□□□ 0.87
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CLSTN3-216ENST00000545663 SPRYD7Q5W111 196 aa20.49■□□□□ 0.87
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CLSTN3-216ENST00000545663 FZD1Q9UP38 647 aa20.48■□□□□ 0.87
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CLSTN3-216ENST00000545663 TCIRG1Q13488 830 aa20.47■□□□□ 0.87
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CLSTN3-216ENST00000545663 ZNF333Q96JL9 665 aa20.47■□□□□ 0.87
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CLSTN3-216ENST00000545663 EFCC1Q9HA90 598 aa20.46■□□□□ 0.87
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CLSTN3-216ENST00000545663 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.45■□□□□ 0.86
CLSTN3-216ENST00000545663 G3V3G9 751 aa20.44■□□□□ 0.86
CLSTN3-216ENST00000545663 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.44■□□□□ 0.86
CLSTN3-216ENST00000545663 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.44■□□□□ 0.86
CLSTN3-216ENST00000545663 ZNF609O15014 1411 aa20.44■□□□□ 0.86
CLSTN3-216ENST00000545663 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CLSTN3-216ENST00000545663 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa20.43■□□□□ 0.86
CLSTN3-216ENST00000545663 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CLSTN3-216ENST00000545663 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
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CLSTN3-216ENST00000545663 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CLSTN3-216ENST00000545663 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.41■□□□□ 0.86
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CLSTN3-216ENST00000545663 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CLSTN3-216ENST00000545663 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CLSTN3-216ENST00000545663 UFL1O94874 794 aa20.4■□□□□ 0.86
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CLSTN3-216ENST00000545663 INHBEP58166 350 aa20.4■□□□□ 0.86
CLSTN3-216ENST00000545663 COPS6Q7L5N1 327 aa20.4■□□□□ 0.86
CLSTN3-216ENST00000545663 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CLSTN3-216ENST00000545663 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.4■□□□□ 0.86
CLSTN3-216ENST00000545663 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.4■□□□□ 0.86
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CLSTN3-216ENST00000545663 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CLSTN3-216ENST00000545663 SP3Q02447 781 aa20.39■□□□□ 0.85
CLSTN3-216ENST00000545663 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CLSTN3-216ENST00000545663 DPF3Q92784 378 aa20.39■□□□□ 0.85
CLSTN3-216ENST00000545663 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.39■□□□□ 0.85
CLSTN3-216ENST00000545663 FAM89AQ96GI7 184 aa20.39■□□□□ 0.85
CLSTN3-216ENST00000545663 PRO3102Q9H379 93 aa20.39■□□□□ 0.85
CLSTN3-216ENST00000545663 WNT10BO00744 389 aa20.38■□□□□ 0.85
CLSTN3-216ENST00000545663 RPS8P62241 208 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CLSTN3-216ENST00000545663 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.38■□□□□ 0.85
CLSTN3-216ENST00000545663 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.38■□□□□ 0.85
CLSTN3-216ENST00000545663 USP17L3A6NCW0 530 aa20.37■□□□□ 0.85
CLSTN3-216ENST00000545663 USP17L4A6NCW7 530 aa20.37■□□□□ 0.85
CLSTN3-216ENST00000545663 SASH1O94885 1247 aa20.37■□□□□ 0.85
CLSTN3-216ENST00000545663 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.37■□□□□ 0.85
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