RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424350.5

ANKRD54-206, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-206ENST00000424350 NEFMP07197 916 aa21.99■■□□□ 1.11
ANKRD54-206ENST00000424350 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
ANKRD54-206ENST00000424350 TCIRG1Q13488 830 aa21.99■■□□□ 1.11
ANKRD54-206ENST00000424350 MOB2Q70IA6 237 aa21.99■■□□□ 1.11
ANKRD54-206ENST00000424350 COPS6Q7L5N1 327 aa21.99■■□□□ 1.11
ANKRD54-206ENST00000424350 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa21.98■■□□□ 1.11
ANKRD54-206ENST00000424350 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
ANKRD54-206ENST00000424350 ZNF428Q96B54 188 aa21.98■■□□□ 1.11
ANKRD54-206ENST00000424350 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.97■■□□□ 1.11
ANKRD54-206ENST00000424350 TM4SF4P48230 202 aa21.97■■□□□ 1.11
ANKRD54-206ENST00000424350 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
ANKRD54-206ENST00000424350 TBC1D16Q8TBP0 767 aa21.97■■□□□ 1.11
ANKRD54-206ENST00000424350 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.97■■□□□ 1.11
ANKRD54-206ENST00000424350 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.97■■□□□ 1.11
ANKRD54-206ENST00000424350 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
ANKRD54-206ENST00000424350 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
ANKRD54-206ENST00000424350 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.96■■□□□ 1.11
ANKRD54-206ENST00000424350 FKTNO75072 461 aa21.95■■□□□ 1.1
ANKRD54-206ENST00000424350 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
ANKRD54-206ENST00000424350 SCN9AQ15858 1988 aa21.94■■□□□ 1.1
ANKRD54-206ENST00000424350 NFE2L2Q16236 605 aa21.94■■□□□ 1.1
ANKRD54-206ENST00000424350 AGBL3Q8NEM8 1001 aa21.94■■□□□ 1.1
ANKRD54-206ENST00000424350 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
ANKRD54-206ENST00000424350 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
ANKRD54-206ENST00000424350 G3V3G9 751 aa21.93■■□□□ 1.1
ANKRD54-206ENST00000424350 DCAF8Q5TAQ9 597 aa21.93■■□□□ 1.1
ANKRD54-206ENST00000424350 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
ANKRD54-206ENST00000424350 NECTIN2Q92692 538 aa21.93■■□□□ 1.1
ANKRD54-206ENST00000424350 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa21.93■■□□□ 1.1
ANKRD54-206ENST00000424350 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
ANKRD54-206ENST00000424350 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa21.92■■□□□ 1.1
ANKRD54-206ENST00000424350 FAM89AQ96GI7 184 aa21.92■■□□□ 1.1
ANKRD54-206ENST00000424350 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.92■■□□□ 1.1
ANKRD54-206ENST00000424350 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa21.92■■□□□ 1.1
ANKRD54-206ENST00000424350 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.92■■□□□ 1.1
ANKRD54-206ENST00000424350 COL4A1P02462 1669 aa21.91■■□□□ 1.1
ANKRD54-206ENST00000424350 POTEFA5A3E0 1075 aa21.91■■□□□ 1.1
ANKRD54-206ENST00000424350 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.1
ANKRD54-206ENST00000424350 SREBF2Q12772 1141 aa21.91■■□□□ 1.1
ANKRD54-206ENST00000424350 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
ANKRD54-206ENST00000424350 CFHR5Q9BXR6 569 aa21.91■■□□□ 1.1
ANKRD54-206ENST00000424350 ZNF609O15014 1411 aa21.9■■□□□ 1.1
ANKRD54-206ENST00000424350 USP17L8P0C7I0 530 aa21.9■■□□□ 1.1
ANKRD54-206ENST00000424350 RPS8P62241 208 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
ANKRD54-206ENST00000424350 PODXL2Q9NZ53 605 aa21.9■■□□□ 1.1
ANKRD54-206ENST00000424350 UFL1O94874 794 aa21.89■■□□□ 1.09
ANKRD54-206ENST00000424350 GMLQ99445 158 aa21.89■■□□□ 1.09
ANKRD54-206ENST00000424350 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
ANKRD54-206ENST00000424350 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa21.88■■□□□ 1.09
ANKRD54-206ENST00000424350 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54-206ENST00000424350 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54-206ENST00000424350 GGA1Q9UJY5 639 aa21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54-206ENST00000424350 TRIM17Q9Y577 477 aa21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54-206ENST00000424350 HTTP42858 3142 aa21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54-206ENST00000424350 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54-206ENST00000424350 NF2P35240 595 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-206ENST00000424350 NBPF9Q3BBW0 867 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-206ENST00000424350 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-206ENST00000424350 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-206ENST00000424350 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-206ENST00000424350 OTOP1Q7RTM1 612 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-206ENST00000424350 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-206ENST00000424350 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-206ENST00000424350 USP17L3A6NCW0 530 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-206ENST00000424350 USP17L4A6NCW7 530 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-206ENST00000424350 ALDH1A1P00352 501 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-206ENST00000424350 USP17L1Q7RTZ2 530 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-206ENST00000424350 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-206ENST00000424350 CENPFP49454 3210 aa21.83■■□□□ 1.08
ANKRD54-206ENST00000424350 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
ANKRD54-206ENST00000424350 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.82■■□□□ 1.08
ANKRD54-206ENST00000424350 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
ANKRD54-206ENST00000424350 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.82■■□□□ 1.08
ANKRD54-206ENST00000424350 PRKG1Q13976 671 aa21.81■■□□□ 1.08
ANKRD54-206ENST00000424350 SPRYD7Q5W111 196 aa21.81■■□□□ 1.08
ANKRD54-206ENST00000424350 ARMC9Q7Z3E5 817 aa21.81■■□□□ 1.08
ANKRD54-206ENST00000424350 PODNQ7Z5L7 613 aa21.81■■□□□ 1.08
ANKRD54-206ENST00000424350 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
ANKRD54-206ENST00000424350 BRCA2P51587 3418 aa21.81■■□□□ 1.08
ANKRD54-206ENST00000424350 EN2P19622 333 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
ANKRD54-206ENST00000424350 PSME4Q14997 1843 aa21.8■■□□□ 1.08
ANKRD54-206ENST00000424350 WNT10BO00744 389 aa21.79■■□□□ 1.08
ANKRD54-206ENST00000424350 RIPK4P57078 832 aa21.79■■□□□ 1.08
ANKRD54-206ENST00000424350 KRT24Q2M2I5 525 aa21.79■■□□□ 1.08
ANKRD54-206ENST00000424350 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
ANKRD54-206ENST00000424350 PTPN22Q9Y2R2 807 aa21.79■■□□□ 1.08
ANKRD54-206ENST00000424350 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
ANKRD54-206ENST00000424350 LDLRAD1Q5T700 205 aa21.78■■□□□ 1.08
ANKRD54-206ENST00000424350 IFNL1Q8IU54 200 aa21.78■■□□□ 1.08
ANKRD54-206ENST00000424350 OGFOD1Q8N543 542 aa21.78■■□□□ 1.08
ANKRD54-206ENST00000424350 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
ANKRD54-206ENST00000424350 INHBEP58166 350 aa21.77■■□□□ 1.08
ANKRD54-206ENST00000424350 MXD3Q9BW11 206 aa21.77■■□□□ 1.08
ANKRD54-206ENST00000424350 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ANKRD54-206ENST00000424350 XDHP47989 1333 aa21.77■■□□□ 1.07
ANKRD54-206ENST00000424350 ATP2B4P23634 1241 aa21.76■■□□□ 1.07
ANKRD54-206ENST00000424350 ARMC5Q96C12 935 aa21.76■■□□□ 1.07
ANKRD54-206ENST00000424350 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
ANKRD54-206ENST00000424350 SASH1O94885 1247 aa21.75■■□□□ 1.07
ANKRD54-206ENST00000424350 DACT2Q5SW24 774 aa21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms