RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SPCS1-201ENST00000233025 COL6A3P12111 3177 aa21.9■■□□□ 1.1
SPCS1-201ENST00000233025 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SPCS1-201ENST00000233025 WASHC4Q2M389 1173 aa21.9■■□□□ 1.1
SPCS1-201ENST00000233025 MOB2Q70IA6 237 aa21.9■■□□□ 1.1
SPCS1-201ENST00000233025 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa21.9■■□□□ 1.1
SPCS1-201ENST00000233025 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.9■■□□□ 1.1
SPCS1-201ENST00000233025 ECE2O60344 883 aa21.89■■□□□ 1.09
SPCS1-201ENST00000233025 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
SPCS1-201ENST00000233025 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
SPCS1-201ENST00000233025 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
SPCS1-201ENST00000233025 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
SPCS1-201ENST00000233025 TMC4Q7Z404 712 aa21.89■■□□□ 1.09
SPCS1-201ENST00000233025 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SPCS1-201ENST00000233025 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SPCS1-201ENST00000233025 DLL1O00548 723 aa21.86■■□□□ 1.09
SPCS1-201ENST00000233025 VIL1P09327 827 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SPCS1-201ENST00000233025 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.86■■□□□ 1.09
SPCS1-201ENST00000233025 POLLQ9UGP5 575 aa21.86■■□□□ 1.09
SPCS1-201ENST00000233025 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa21.85■■□□□ 1.09
SPCS1-201ENST00000233025 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.85■■□□□ 1.09
SPCS1-201ENST00000233025 RIMBP2O15034 1052 aa21.85■■□□□ 1.09
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SPCS1-201ENST00000233025 SCARF1Q14162 830 aa21.85■■□□□ 1.09
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SPCS1-201ENST00000233025 ERBB4Q15303 1308 aa21.84■■□□□ 1.09
SPCS1-201ENST00000233025 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SPCS1-201ENST00000233025 SREBF2Q12772 1141 aa21.84■■□□□ 1.09
SPCS1-201ENST00000233025 DOK7Q18PE1 504 aa21.84■■□□□ 1.09
SPCS1-201ENST00000233025 OTOP1Q7RTM1 612 aa21.84■■□□□ 1.09
SPCS1-201ENST00000233025 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM17Q9Y577 477 aa21.83■■□□□ 1.09
SPCS1-201ENST00000233025 EN2P19622 333 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SPCS1-201ENST00000233025 NLRP10Q86W26 655 aa21.82■■□□□ 1.08
SPCS1-201ENST00000233025 GPSM2P81274 684 aa21.81■■□□□ 1.08
SPCS1-201ENST00000233025 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SPCS1-201ENST00000233025 ARMC5Q96C12 935 aa21.81■■□□□ 1.08
SPCS1-201ENST00000233025 C6orf229H3BNL8 230 aa21.8■■□□□ 1.08
SPCS1-201ENST00000233025 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SPCS1-201ENST00000233025 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SPCS1-201ENST00000233025 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.8■■□□□ 1.08
SPCS1-201ENST00000233025 PDIA6Q15084 440 aa21.79■■□□□ 1.08
SPCS1-201ENST00000233025 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SPCS1-201ENST00000233025 OTUD5Q96G74 571 aa21.79■■□□□ 1.08
SPCS1-201ENST00000233025 EYA3Q99504 573 aa21.79■■□□□ 1.08
SPCS1-201ENST00000233025 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SPCS1-201ENST00000233025 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa21.78■■□□□ 1.08
SPCS1-201ENST00000233025 AGBL3Q8NEM8 1001 aa21.78■■□□□ 1.08
SPCS1-201ENST00000233025 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D16Q8TBP0 767 aa21.77■■□□□ 1.08
SPCS1-201ENST00000233025 NECTIN2Q92692 538 aa21.77■■□□□ 1.08
SPCS1-201ENST00000233025 GMLQ99445 158 aa21.77■■□□□ 1.08
SPCS1-201ENST00000233025 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.77■■□□□ 1.08
SPCS1-201ENST00000233025 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SPCS1-201ENST00000233025 PTPN22Q9Y2R2 807 aa21.77■■□□□ 1.08
SPCS1-201ENST00000233025 LAMA3Q16787 3333 aa21.77■■□□□ 1.08
SPCS1-201ENST00000233025 ALDH1A1P00352 501 aa21.76■■□□□ 1.07
SPCS1-201ENST00000233025 PROSER3Q2NL68 480 aa21.76■■□□□ 1.07
SPCS1-201ENST00000233025 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SPCS1-201ENST00000233025 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.75■■□□□ 1.07
SPCS1-201ENST00000233025 SLC17A8Q8NDX2 589 aa21.75■■□□□ 1.07
SPCS1-201ENST00000233025 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SPCS1-201ENST00000233025 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
SPCS1-201ENST00000233025 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.07
SPCS1-201ENST00000233025 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SPCS1-201ENST00000233025 SPRYD7Q5W111 196 aa21.74■■□□□ 1.07
SPCS1-201ENST00000233025 H0YGN5 161 aa21.73■■□□□ 1.07
SPCS1-201ENST00000233025 ANXA1P04083 346 aa21.73■■□□□ 1.07
SPCS1-201ENST00000233025 USP17L8P0C7I0 530 aa21.73■■□□□ 1.07
SPCS1-201ENST00000233025 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SPCS1-201ENST00000233025 CFAP53Q96M91 514 aa21.73■■□□□ 1.07
SPCS1-201ENST00000233025 NUDCQ9Y266 331 aa21.73■■□□□ 1.07
SPCS1-201ENST00000233025 TCIRG1Q13488 830 aa21.72■■□□□ 1.07
SPCS1-201ENST00000233025 IFNL1Q8IU54 200 aa21.72■■□□□ 1.07
SPCS1-201ENST00000233025 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
SPCS1-201ENST00000233025 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SPCS1-201ENST00000233025 PODXL2Q9NZ53 605 aa21.72■■□□□ 1.07
SPCS1-201ENST00000233025 NBPF9Q3BBW0 867 aa21.71■■□□□ 1.07
SPCS1-201ENST00000233025 ERO1AQ96HE7 468 aa21.71■■□□□ 1.07
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF333Q96JL9 665 aa21.71■■□□□ 1.07
SPCS1-201ENST00000233025 NF2P35240 595 aa21.7■■□□□ 1.06
SPCS1-201ENST00000233025 CAP1Q01518 475 aa21.7■■□□□ 1.06
SPCS1-201ENST00000233025 LDLRAD1Q5T700 205 aa21.7■■□□□ 1.06
SPCS1-201ENST00000233025 CD99L2Q8TCZ2 262 aa21.7■■□□□ 1.06
SPCS1-201ENST00000233025 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP21.69■■□□□ 1.06
SPCS1-201ENST00000233025 SLC4A2P04920 1241 aa21.69■■□□□ 1.06
SPCS1-201ENST00000233025 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SPCS1-201ENST00000233025 CHRDL2Q6WN34 429 aa21.69■■□□□ 1.06
SPCS1-201ENST00000233025 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.69■■□□□ 1.06
SPCS1-201ENST00000233025 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
SPCS1-201ENST00000233025 UFL1O94874 794 aa21.68■■□□□ 1.06
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF428Q96B54 188 aa21.68■■□□□ 1.06
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM106CQ9BVX2 250 aa21.68■■□□□ 1.06
SPCS1-201ENST00000233025 INHBEP58166 350 aa21.67■■□□□ 1.06
SPCS1-201ENST00000233025 COPS6Q7L5N1 327 aa21.67■■□□□ 1.06
SPCS1-201ENST00000233025 ARMC9Q7Z3E5 817 aa21.67■■□□□ 1.06
SPCS1-201ENST00000233025 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.67■■□□□ 1.06
SPCS1-201ENST00000233025 EFCC1Q9HA90 598 aa21.67■■□□□ 1.06
SPCS1-201ENST00000233025 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SPCS1-201ENST00000233025 G3V3G9 751 aa21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63 ms