RNA–Protein interactions for RNA: YPL149W

ATG5, Transcript of Conserved protein involved in autophagy and the Cvt pathway, yeast

Gene ATG5, Length 885 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG5	YPL149W	THI21	Q08975	551 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	TMA17	Q12513	150 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	SED4	P25365	1065 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	SDP1	P40479	209 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	MET12	P46151	657 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	ECL1	P48235	211 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	SPT20	P50875	604 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	ZIP2	P53061	704 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	GCN5	Q03330	439 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	YAP6	Q03935	383 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	HFD1	Q04458	532 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	RXT3	Q07458	294 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	HMI1	Q12039	706 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	FBP1	P09201	348 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	SEG2	P34250	1132 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	YHR078W	P38799	552 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	CTF8	P38877	133 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	CKB2	P38930	258 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	DUS4	Q06063	367 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	UPC2	Q12151	913 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	HIS5	P07172	385 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	CDC6	P09119	513 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	SSY5	P47002	699 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	YJR120W	P47157	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	VPS62	P53285	467 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	FOL1	P53848	824 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG5	YPL149W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	FLR1	P38124	548 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	TDA3	P38758	523 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	SAK1	P38990	1142 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	BNA2	P47125	453 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	YGR153W	P48238	217 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	MRC1	P25588	1096 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	CDC20	P26309	610 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	STE14	P32584	239 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	PZF1	P39933	429 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	NPC2	Q12408	173 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	EUG1	P32474	517 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	PAF1	P38351	445 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	RET2	P43621	546 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	YJR008W	P47085	338 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	NCS6	P53088	359 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	ASM4	Q05166	528 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	CDA2	Q06703	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	TRE2	Q08693	809 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	MSS4	P38994	779 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	NIT1	P40447	199 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	VHR1	P40522	640 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	PFA3	P42836	336 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	CHA4	P43634	648 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	PCL10	P53124	433 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	SWM1	Q12379	170 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	MNN4	P36044	1178 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	YKR018C	P36114	725 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	GRX7	P38068	203 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	PLB1	P39105	664 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	ASI2	P53895	289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	SOD2	P00447	233 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	TOD6	P34219	525 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	RIM8	P53179	542 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	ARP4	P80428	489 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	PKH1	Q03407	766 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	TMA10	Q06177	86 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG5	YPL149W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG5	YPL149W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG5	YPL149W	DAL3	P32459	195 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG5	YPL149W	YBR071W	P38243	211 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG5	YPL149W	COG6	P53959	839 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG5	YPL149W	ORC4	P54791	529 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG5	YPL149W	ECM9	Q02202	377 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG5	YPL149W	PEX19	Q07418	342 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG5	YPL149W	DCS2	Q12123	353 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG5	YPL149W	GPR1	Q12361	961 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG5	YPL149W	RNQ1	P25367	405 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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