RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM10	YOL093W	FOL1	P53848	824 aa		5.5	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	MRPL22	P53881	309 aa		5.5	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	HRQ1	Q05549	1077 aa		5.5	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	YLR407W	Q06070	228 aa		5.5	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	SKG3	Q06315	1026 aa		5.5	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	LAP2	Q10740	671 aa		5.5	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	GIN4	Q12263	1142 aa		5.5	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	YOR111W	Q99210	232 aa		5.5	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	TUS1	Q06412	1307 aa		5.49	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	VAB2	P40003	282 aa		5.49	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	NUT1	P53114	1132 aa		5.49	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	RTC4	P53850	401 aa		5.49	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	TIP41	Q12199	356 aa		5.49	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	CSR2	Q12734	1121 aa		5.49	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	CHS3	P29465	1165 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	TOD6	P34219	525 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	YKR018C	P36114	725 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	PPX1	P38698	397 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	SHU2	P38957	223 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	ACA1	P39970	489 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	LYS14	P40971	790 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	SOL4	P53315	255 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	PNS1	Q12412	539 aa		5.48	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	NUC1	P08466	329 aa		5.47	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	OCT1	P35999	772 aa		5.47	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	YAF9	P53930	226 aa		5.47	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	MDM1	Q01846	1127 aa		5.47	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	CSM3	Q04659	317 aa		5.47	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	DSE3	Q08729	430 aa		5.47	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	TRE1	Q08919	783 aa		5.47	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	YDL177C	Q12257	170 aa		5.47	□□□□□ -1.53
TRM10	YOL093W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	CLC1	P17891	233 aa		5.46	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	ACE2	P21192	770 aa		5.46	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	RDS1	P25611	832 aa		5.46	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	PER1	P25625	357 aa		5.46	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	VPS35	P34110	944 aa		5.46	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	MCD4	P36051	919 aa		5.46	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	MAL33	P38157	468 aa		5.46	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	HUL5	P53119	910 aa		5.46	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	HDA1	P53973	706 aa		5.46	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	YCS4	Q06156	1176 aa		5.46	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	GPI13	Q07830	1017 aa		5.46	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	TAF13	P11747	167 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	RPN12	P32496	274 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	DUR3	P33413	735 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	SLD2	P34252	453 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	PCI8	P40512	444 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	YGL138C	P53122	345 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	YLH47	Q06493	454 aa		5.45	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	SOD2	P00447	233 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	ALG1	P16661	449 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	GSY1	P23337	708 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	PRO1	P32264	428 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	YKL077W	P36081	392 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	CIR1	P42940	261 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	RET3	P53600	189 aa		5.44	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	CDC6	P09119	513 aa		5.43	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	DID4	P36108	232 aa		5.43	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	YIL089W	P40500	205 aa		5.43	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	MON1	P53129	644 aa		5.43	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	MFM1	Q02783	413 aa		5.43	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	YML037C	Q03703	340 aa		5.43	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	OXR1	Q08952	273 aa		5.43	□□□□□ -1.54
TRM10	YOL093W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 50.3 ms