RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	TOM20	P35180	183 aa		6.35	□□□□□ -1.39
PSH1	YOL054W	BET3	P36149	193 aa		6.35	□□□□□ -1.39
PSH1	YOL054W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
PSH1	YOL054W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
PSH1	YOL054W	CEP3	P40969	608 aa		6.35	□□□□□ -1.39
PSH1	YOL054W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
PSH1	YOL054W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.35	□□□□□ -1.39	not detected
PSH1	YOL054W	TIM50	Q02776	476 aa		6.35	□□□□□ -1.39
PSH1	YOL054W	RMT2	Q03305	412 aa		6.35	□□□□□ -1.39
PSH1	YOL054W	GIC2	Q06648	383 aa		6.35	□□□□□ -1.39
PSH1	YOL054W	NTG2	Q08214	380 aa		6.35	□□□□□ -1.39
PSH1	YOL054W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		6.35	□□□□□ -1.39
PSH1	YOL054W	RDS1	P25611	832 aa		6.34	□□□□□ -1.39
PSH1	YOL054W	MAL33	P38157	468 aa		6.34	□□□□□ -1.39
PSH1	YOL054W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
PSH1	YOL054W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
PSH1	YOL054W	SSL2	Q00578	843 aa		6.34	□□□□□ -1.39
PSH1	YOL054W	UGO1	Q03327	502 aa		6.34	□□□□□ -1.39
PSH1	YOL054W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
PSH1	YOL054W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
PSH1	YOL054W	TDA6	Q06466	467 aa		6.34	□□□□□ -1.39
PSH1	YOL054W	SSP2	Q08646	371 aa		6.34	□□□□□ -1.39
PSH1	YOL054W	SPO21	Q12411	609 aa		6.34	□□□□□ -1.39
PSH1	YOL054W	HBN1	Q96VH4	193 aa		6.34	□□□□□ -1.39
PSH1	YOL054W	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	ADR1	P07248	1323 aa		6.33	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		6.33	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		6.33	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	OPI1	P21957	404 aa		6.33	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	LTV1	P34078	463 aa		6.33	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	6.33	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	PIB2	P53191	635 aa		6.33	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	ARP5	P53946	755 aa		6.33	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	VPS64	Q03944	604 aa		6.33	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	KIP1	P28742	1111 aa		6.32	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	DOM34	P33309	386 aa		6.32	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	NNK1	P36003	928 aa		6.32	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	GDH3	P39708	457 aa		6.32	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	6.32	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.32	□□□□□ -1.4	not detected
PSH1	YOL054W	YPT11	P48559	417 aa		6.32	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	YKE2	P52553	114 aa		6.32	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	YBP2	P53169	641 aa		6.32	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	SGD1	Q06132	899 aa		6.32	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	SFI1	Q12369	946 aa		6.32	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	GPA1	P08539	472 aa		6.31	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	YER152C	P10356	443 aa		6.31	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	SPC110	P32380	944 aa		6.31	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	PEX6	P33760	1030 aa		6.31	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	YBR284W	P38150	797 aa		6.31	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	RRM3	P38766	723 aa		6.31	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	CIN4	P39110	191 aa		6.31	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	YMR187C	Q03236	431 aa		6.31	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	YLR407W	Q06070	228 aa		6.31	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	ATG13	Q06628	738 aa		6.31	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	ADE8	P04161	214 aa		6.3	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	PET111	P08468	800 aa		6.3	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	PNT1	P38969	423 aa		6.3	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	YER130C	P39959	443 aa		6.3	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	YEN1	P40028	759 aa		6.3	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	VID28	P40547	921 aa		6.3	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	TFB2	Q02939	513 aa		6.3	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	RIM15	P43565	1770 aa		6.3	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	GSY1	P23337	708 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	GSY2	P27472	705 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	PEP3	P27801	918 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	UGA2	P38067	497 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	RFC5	P38251	354 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	DSS1	P39112	969 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	GPB2	P39717	880 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	HLJ1	P48353	224 aa		6.29	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	SAC3	P46674	1301 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	TOP3	P13099	656 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	MRC1	P25588	1096 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	PET10	P36139	283 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PSH1	YOL054W	SIT1	P39980	628 aa		6.28	□□□□□ -1.4

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