RNA–Protein interactions for RNA: YMR306W

FKS3, Transcript of Protein involved in spore wall assembly, yeast

Gene FKS3, Length 5,358 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FKS3	YMR306W	YNL018C	P53976	612 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	TIM8	P57744	87 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	BI4	P03879	638 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	GAL80	P04387	435 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	CBF2	P32504	956 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	SEG2	P34250	1132 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	MFB1	Q04922	465 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	FUS2	Q05670	677 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	IRC10	Q08118	586 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	PPZ1	P26570	692 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	YJR079W	P47126	109 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	TAM41	P53230	385 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	TBF1	Q02457	562 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	PNG1	Q02890	363 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	WAR1	Q03631	944 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	VPS20	Q04272	221 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	ADY4	Q05955	493 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	FOB1	O13329	566 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	APE1	P14904	514 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	MET4	P32389	672 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	UBX7	P38349	436 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	CHS6	P40955	746 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	ALT1	P52893	592 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	SPC98	P53540	846 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	SFB2	P53953	876 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	YDL073W	Q07454	984 aa		2.77	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	JIP3	O13555	125 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	BIO2	P32451	375 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	SWI3	P32591	825 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	AVT1	P47082	602 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	YML053C	Q04978	212 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	YLR407W	Q06070	228 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	HRT3	Q12347	344 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	SPE1	P08432	466 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	SMC1	P32908	1225 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	MED6	P38782	295 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	STP1	Q00947	519 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	DON1	Q05610	365 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	NIP100	P33420	868 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	SSP1	P38871	571 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	YER186C	P40101	306 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	MAF1	P41910	395 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	RGA2	Q06407	1009 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	RAM1	P22007	431 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	GUT1	P32190	709 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	SGE1	P33335	543 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	HFM1	P51979	1187 aa		2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	CDC6	P09119	513 aa		2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	PEX1	P24004	1043 aa		2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	HCM1	P25364	564 aa		2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	NEM1	P38757	446 aa		2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	MGA2	P40578	1113 aa		2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	TOS3	P43637	560 aa		2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	OPY2	Q06810	360 aa		2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	YPR084W	Q06821	456 aa		2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	NCR1	Q12200	1170 aa		2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	RAD3	P06839	778 aa		2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	KIP1	P28742	1111 aa		2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	SPT8	P38915	602 aa		2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	YGR153W	P48238	217 aa		2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	ZPS1	Q12512	249 aa		2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	MYO1	P08964	1928 aa		2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	KTR4	P38131	464 aa		2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
FKS3	YMR306W	ORC5	P50874	479 aa		2.75	□□□□□ -1.97

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