RNA–Protein interactions for RNA: YLR347W-A

YLR347W-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR347W-A, Length 141 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR347W-AYLR347W-A TFB2Q02939 513 aa4.9□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data4.89□□□□□ -1.63not detected
YLR347W-AYLR347W-A MCM6P53091 1017 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A ESC8Q08119 714 aa4.89□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A GUP2Q08929 609 aa4.89□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A RPL8AP17076 256 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A SEC21P32074 935 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A YEL1P34225 687 aa4.88□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A SLU7Q02775 382 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A YDR338CQ05497 695 aa4.88□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A YLR001CQ07895 862 aa4.88□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A TUB3P09734 445 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A RAD18P10862 487 aa4.87□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A KAR4P25583 335 aa4.87□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A PCL2P25693 308 aa4.87□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A CTS1P29029 562 aa4.87□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A SFP1P32432 683 aa4.87□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A HOG1P32485 435 aa4.87□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A RPN10P38886 268 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A SSY5P47002 699 aa4.87□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A ZIP2P53061 704 aa4.87□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A DNM1P54861 757 aa4.87□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A INO80P53115 1489 aa4.87□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A DCG1P32460 244 aa4.86□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A YJR142WP47173 342 aa4.86□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A YNL193WP53870 558 aa4.86□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A COG8Q04632 607 aa4.86□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A CRR1Q05790 422 aa4.86□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A ENB1Q08299 606 aa4.86□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A SWM1Q12379 170 aa4.86□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A YGR161W-CQ3E744 92 aa4.86□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A MIH1P23748 554 aa4.85□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A MSS4P38994 779 aa4.85□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A PZF1P39933 429 aa4.85□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A TAF1P46677 1066 aa4.85□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A ASI2P53895 289 aa4.85□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A NHX1Q04121 633 aa4.85□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A PEX19Q07418 342 aa4.85□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A LAS17Q12446 633 aa4.85□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A ADR1P07248 1323 aa4.85□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A MON2P48563 1636 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A PMA1P05030 918 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A PRP4P20053 465 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A SFL1P20134 766 aa4.84□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A CAD1P24813 409 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A SHM2P37291 469 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A SAK1P38990 1142 aa4.84□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A GIP4P39732 760 aa4.84□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A VHR1P40522 640 aa4.84□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
YLR347W-AYLR347W-A SGS1P35187 1447 aa4.83□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A PFK1P16861 987 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A HSL7P38274 827 aa4.83□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A PCM1P38628 557 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A PFA3P42836 336 aa4.83□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A YFL052WP43551 465 aa4.83□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A BNA2P47125 453 aa4.83□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A NPY1P53164 384 aa4.83□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A ATG33Q06485 197 aa4.83□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A GPR1Q12361 961 aa4.83□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A TRM11Q12463 433 aa4.83□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A YLR149CQ99296 730 aa4.83□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A HMG1P12683 1054 aa4.82□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A HCM1P25364 564 aa4.82□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A YCR015CP25616 317 aa4.82□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A NGG1P32494 702 aa4.82□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A CTF13P35203 478 aa4.82□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A MGS1P40151 587 aa4.82□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A MTR3P48240 250 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A AIM14P53109 570 aa4.82□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A MET13P53128 600 aa4.82□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A SDA1P53313 767 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A PKH1Q03407 766 aa4.82□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A YKR051WP36142 418 aa4.81□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A DOT6P40059 670 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A HLJ1P48353 224 aa4.81□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A PHO23P50947 330 aa4.81□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A ERG5P54781 538 aa4.81□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A ASM4Q05166 528 aa4.81□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A GIN4Q12263 1142 aa4.81□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A NTO1Q12311 748 aa4.81□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A Q0142Q9ZZW4 58 aa4.81□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A YLR415CO13578 112 aa4.8□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A YKL222CP35995 705 aa4.8□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A RPP1P38786 293 aa4.8□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A CRP1P38845 465 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A BUL1P48524 976 aa4.8□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A UBC9P50623 157 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A YNR029CP53729 429 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A RPN7Q06103 429 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A GUD1Q07729 489 aa4.8□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A TRP4P07285 380 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A CCR4P31384 837 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A YKR018CP36114 725 aa4.79□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A SIC1P38634 284 aa4.79□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A THI73Q07904 523 aa4.79□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A PMI40P29952 429 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A DEF1P35732 738 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
YLR347W-AYLR347W-A YGL081WP53156 320 aa4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.1 ms