RNA–Protein interactions for RNA: YGR215W

RSM27, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene RSM27, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RSM27	YGR215W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RSM27	YGR215W	DIF1	O13577	133 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	CDC9	P04819	755 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	VBA3	P25594	458 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	ENB1	Q08299	606 aa		5.15	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	GSY1	P23337	708 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	MSH2	P25847	964 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	PZF1	P39933	429 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	HXT16	P47185	567 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	SUN4	P53616	420 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	ALG12	P53730	551 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	AIM39	Q08223	395 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	MDM12	Q92328	271 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	MTC2	P34246	357 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	AIM21	P40563	679 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	KIN4	Q01919	800 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	PKH1	Q03407	766 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	THI21	Q08975	551 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	PEX6	P33760	1030 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	MCD4	P36051	919 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	MSE1	P48525	536 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	ASI2	P53895	289 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	ASM4	Q05166	528 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	YDR338C	Q05497	695 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	NTG2	Q08214	380 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	RAD18	P10862	487 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	CTF13	P35203	478 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	RPP1	P38786	293 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	FKH2	P41813	862 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	PFA3	P42836	336 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	BUL1	P48524	976 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	ZIP2	P53061	704 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	TRM11	Q12463	433 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	MRPS35	P53292	345 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	UGO1	Q03327	502 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	PUS9	Q12069	462 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	TRM13	Q12383	476 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		5.1	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	SRD1	P09007	221 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	SUL1	P38359	859 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	YFL052W	P43551	465 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	ERG5	P54781	538 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	YLR040C	Q07988	224 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RSM27	YGR215W	NGG1	P32494	702 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	CAF16	P43569	289 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	YLR415C	O13578	112 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	ERG4	P25340	473 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	NPY1	P53164	384 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	NRG1	Q03125	231 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	PNS1	Q12412	539 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	YLR149C	Q99296	730 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	MET3	P08536	511 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	YKR051W	P36142	418 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	TFB2	Q02939	513 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	YMR206W	Q03695	313 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	NHX1	Q04121	633 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	HOG1	P32485	435 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	MNN1	P39106	762 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	ELO3	P40319	345 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	MUP1	P50276	574 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	AIM14	P53109	570 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	DLT1	Q04216	342 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	YOL073C	Q08232	322 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	GPR1	Q12361	961 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	MIH1	P23748	554 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	KTR4	P38131	464 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	RNT1	Q02555	471 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	ALG7	P07286	448 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	HSL7	P38274	827 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	BNA2	P47125	453 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	YBP2	P53169	641 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	SLI1	P53304	468 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	FRE5	Q08908	694 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	TGL5	Q12043	749 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RSM27	YGR215W	PCL2	P25693	308 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	SFP1	P32432	683 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	SIC1	P38634	284 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RSM27	YGR215W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61

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