RNA–Protein interactions for RNA: YGR102C

GTF1, Transcript of Subunit of the trimeric GatFAB AmidoTransferase(AdT) complex, yeast

Gene GTF1, Length 552 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GTF1	YGR102C	YGR237C	P50089	785 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	YNL193W	P53870	558 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	RIP-Chip
GTF1	YGR102C	DUS4	Q06063	367 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
GTF1	YGR102C	GNT1	Q12096	491 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	TMA17	Q12513	150 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GTF1	YGR102C	APL1	P27351	700 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	MBP1	P39678	833 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	MDM12	Q92328	271 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	BI4	P03879	638 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	KAR1	P11927	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	SLA2	P33338	968 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	YKL107W	P34251	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	PNT1	P38969	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	RIA1	P53893	1110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	THI73	Q07904	523 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	SLX4	Q12098	748 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	YLR358C	O13565	187 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	ACE2	P21192	770 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	YGL176C	P46945	554 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	YLR001C	Q07895	862 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	ACM1	Q08981	209 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	CDC6	P09119	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	CDC11	P32458	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	CCC2	P38995	1004 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	GCV2	P49095	1034 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	HFM1	P51979	1187 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	GPG1	P53130	126 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	UME1	Q03010	460 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	ATP4	P05626	244 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	MEF1	P25039	761 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	CDC20	P26309	610 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	CTS1	P29029	562 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	YJR120W	P47157	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	YDL121C	Q07541	149 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	XYL2	Q07993	356 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	NUP145	P49687	1317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	PDR11	P40550	1411 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	TOP3	P13099	656 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	DPB3	P27344	201 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	DOM34	P33309	386 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	FUI1	P38196	639 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	MGS1	P40151	587 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	MTC3	P53077	123 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	MSC2	Q03455	724 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	SIZ1	Q04195	904 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	GPB1	Q08886	897 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	GIN4	Q12263	1142 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	BCK1	Q01389	1478 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	KRE5	P22023	1365 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	GSY1	P23337	708 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	EUG1	P32474	517 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	YKL151C	P36059	337 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	YBR071W	P38243	211 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
GTF1	YGR102C	DSS1	P39112	969 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
GTF1	YGR102C	DAS1	P47005	663 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	COG6	P53959	839 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GTF1	YGR102C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	RAD53	P22216	821 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	LST4	P34239	828 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	PET10	P36139	283 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	YBR284W	P38150	797 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	TGL2	P54857	326 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	SND1	Q04007	877 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	HFD1	Q04458	532 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	RXT3	Q07458	294 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	EMC1	P25574	760 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	VBA3	P25594	458 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	HIR1	P32479	840 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	YEL1	P34225	687 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	SIT1	P39980	628 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	RRT14	P40470	206 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GTF1	YGR102C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64

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