RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	UBP15	P50101	1230 aa		3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	SPC105	P53148	917 aa		3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	YNL108C	P53929	270 aa		3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	SVF1	Q05515	481 aa		3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	PHM6	Q05637	104 aa		3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	VPS38	Q05919	439 aa		3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.82	□□□□□ -1.8	not detected
XRS2	YDR369C	POM152	P39685	1337 aa		3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	DAP2	P18962	818 aa		3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	CLB2	P24869	491 aa		3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	VPS51	P36116	164 aa		3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	MET1	P36150	593 aa		3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	PXL1	P36166	706 aa		3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	RGA1	P39083	1007 aa		3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	MBP1	P39678	833 aa		3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	RSM7	P47150	247 aa		3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	BRO1	P48582	844 aa		3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	NUP84	P52891	726 aa		3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	VPS16	Q03308	798 aa		3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	HFD1	Q04458	532 aa		3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	YOL057W	Q08225	711 aa		3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	OSW1	Q08692	278 aa		3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	TAF10	Q12030	206 aa		3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	GET4	Q12125	312 aa		3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	SEY1	Q99287	776 aa		3.82	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	PHO13	P19881	312 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	RAD53	P22216	821 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	JNM1	P36224	373 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	YER130C	P39959	443 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	LYS14	P40971	790 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	SNZ3	P43545	298 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	ATG1	P53104	897 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	LIF1	P53150	421 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	SNZ2	P53824	298 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	PGA2	P53903	129 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	TAF12	Q03761	539 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	VAC14	Q06708	880 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	ICL2	Q12031	575 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	YLR125W	Q12138	136 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	ARP6	Q12509	438 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	CDC8	P00572	216 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	PMA2	P19657	947 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	HNM1	P19807	563 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	SMC1	P32908	1225 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	XRS2	P33301	854 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	PXA2	P34230	853 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	SER3	P40054	469 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	YER186C	P40101	306 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	QDR2	P40474	542 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	XKS1	P42826	600 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	RIM21	P48565	533 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	RFX1	P48743	811 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	KAP114	P53067	1004 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	MRM2	P53123	320 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	RPM2	Q02773	1202 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	INA17	Q02888	182 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	USA1	Q03714	838 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	COA4	Q05809	96 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	RTP1	Q12751	981 aa		3.81	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	REC107	P21651	314 aa		3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	RPC53	P25441	422 aa		3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	MEI4	P29467	408 aa		3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	ITR1	P30605	584 aa		3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	CPR5	P35176	225 aa		3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	MNT3	P40549	630 aa		3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	YFH7	P43591	353 aa		3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	GNP1	P48813	663 aa		3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	SRL4	Q03085	281 aa		3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	ATP25	Q03153	612 aa		3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	VTI1	Q04338	217 aa		3.8	□□□□□ -1.8
XRS2	YDR369C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8

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