RNA–Protein interactions for RNA: YDR101C

ARX1, Transcript of Nuclear export factor for the ribosomal pre-60S subunit, yeast

Gene ARX1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ARX1	YDR101C	PNT1	P38969	423 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	TMA108	P40462	946 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	SPO74	P45819	413 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	HST3	P53687	447 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	ENA2	Q01896	1091 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	VPS30	Q02948	557 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	YDR514C	Q04408	483 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	SOG2	Q08817	791 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	TFC3	P34111	1160 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	TDA3	P38758	523 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	SRB7	P47822	140 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	ATP25	Q03153	612 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	YMR018W	Q04364	514 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	YMR074C	Q04773	145 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	YDR338C	Q05497	695 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	YML133C	Q03099	1374 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	RIM15	P43565	1770 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	MSS18	P08593	268 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	YKU70	P32807	602 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	AFR1	P33304	620 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	CLA4	P48562	842 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	NIT3	P49954	291 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	ECM9	Q02202	377 aa		4.96	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
ARX1	YDR101C	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	EMC3	P36039	253 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	ERR3	P42222	437 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	QRI7	P43122	407 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	YJR098C	P47139	656 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	NPY1	P53164	384 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	CAF120	P53836	1060 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	SKY1	Q03656	742 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	NHX1	Q04121	633 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	PEX15	Q08215	383 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	CDC4	P07834	779 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	OPI1	P21957	404 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	NPP1	P25353	742 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	BEM3	P32873	1128 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	ASH1	P34233	588 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	YAR028W	P39548	234 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	MXR1	P40029	184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	RET2	P43621	546 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	VPS53	P47061	822 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	MEC3	Q02574	474 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	HIF1	Q12373	385 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	SNF2	P22082	1703 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	MRP10	O75012	95 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	GUP1	P53154	560 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	LSC2	P53312	427 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	GTR1	Q00582	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	HIM1	Q06674	414 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	YPL260W	Q08977	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	ENV7	Q12003	364 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	YOL114C	Q12322	202 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	SPO21	Q12411	609 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	RSF2	P46974	1380 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	AFT1	P22149	690 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	OPY2	Q06810	360 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	AVO1	Q08236	1176 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	MED1	Q12321	566 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	TCB1	Q12466	1186 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	MSM1	P22438	575 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	TRS130	Q03660	1102 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	SPC19	Q03954	165 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	YHM2	Q04013	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	RER1	P25560	188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	MSH1	P25846	959 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	KIP1	P28742	1111 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	PRO1	P32264	428 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	SWI3	P32591	825 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARX1	YDR101C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 28.1 ms