RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 LARGE1O95461 756 aa15.03■□□□□ -0
RABGEF1-211ENST00000503687 VPS53Q5VIR6 699 aa15.03■□□□□ -0
RABGEF1-211ENST00000503687 CDC37L1Q7L3B6 337 aa15.03■□□□□ -0
RABGEF1-211ENST00000503687 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
RABGEF1-211ENST00000503687 CPS1P31327 1500 aa15.02■□□□□ -0
RABGEF1-211ENST00000503687 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
RABGEF1-211ENST00000503687 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
RABGEF1-211ENST00000503687 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa15.02■□□□□ -0
RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC186Q7Z3E2 898 aa15.02■□□□□ -0
RABGEF1-211ENST00000503687 FSIP1Q8NA03 581 aa15.02■□□□□ -0
RABGEF1-211ENST00000503687 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
RABGEF1-211ENST00000503687 IL25Q9H293 177 aa15.02■□□□□ -0
RABGEF1-211ENST00000503687 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa15.02■□□□□ -0
RABGEF1-211ENST00000503687 OFD1O75665 1012 aa15.02□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP15.02□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 ERICH2A1L162 156 aa15.02□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa15.02□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 ABCF2Q9UG63 623 aa15.02□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 C8orf76Q96K31 380 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 GOLGA8BA8MQT2 603 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP15.01□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 MPHOSPH8Q99549 860 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 CLIP2Q9UDT6 1046 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 STAP2Q9UGK3 403 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 RXRAP19793 462 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 GCKRQ14397 625 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 TMOD3Q9NYL9 352 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 TPCN1Q9ULQ1 816 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa15□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 NPHP3Q7Z494 1330 aa15□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa15□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 CBX1P83916 185 aa15□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 MICU3Q86XE3 530 aa15□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 TYRO3Q06418 890 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 BICDL1Q6ZP65 573 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM89AQ96GI7 184 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 TTLL5Q6EMB2 1281 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF213O14771 459 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 SERPINC1P01008 464 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 PTGS1P23219 599 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 SLFNL1Q499Z3 407 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 CEP57L1Q8IYX8 460 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 PAG1Q9NWQ8 432 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 CTNNA3Q9UI47 895 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 MYO5BQ9ULV0 1848 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 TNNI3KQ59H18 835 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 PI4K2BQ8TCG2 481 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 AIDAQ96BJ3 306 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC112Q8NEF3 446 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 TPM3P06753 285 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 LIG1P18858 919 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 HMG20BQ9P0W2 317 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 AXIN2Q9Y2T1 843 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 MYO3AQ8NEV4 1616 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 NEURL1BA8MQ27 555 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 TDO2P48775 406 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 PPP1R9BQ96SB3 815 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 MED14O60244 1454 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 MINDY4BA8MYZ0 360 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 RPS6KB1P23443 525 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM200AQ8TCP9 573 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 MTMR6Q9Y217 621 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 CD163L1Q9NR16 1453 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 RICTORQ6R327 1708 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 SPDYE4A6NLX3 237 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC34Q96HJ3 373 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC52A2Q9HAB3 445 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 PTPRUQ92729 1446 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 HOXB7P09629 217 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 CUL4AQ13619 759 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 LRP2BPQ9P2M1 347 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 MYOM1P52179 1685 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A087WWV3 80 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 BABAM1Q9NWV8 329 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGEF1-211ENST00000503687 SASH1O94885 1247 aa14.96□□□□□ -0.02
RABGEF1-211ENST00000503687 STARD3NLO95772 234 aa14.96□□□□□ -0.02
RABGEF1-211ENST00000503687 TNNT1P13805 278 aa14.96□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms