RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 THSD7BQ9C0I4 1608 aa5.92□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 POTEB3A0JP26 581 aa5.91□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 MMP10P09238 476 aa5.91□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 DPEP1P16444 411 aa5.91□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa5.91□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 POTEBQ6S5H4 581 aa5.91□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
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ECHDC1-211ENST00000460558 CDK19Q9BWU1 502 aa5.91□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 MCOLN1Q9GZU1 580 aa5.91□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 PIM2Q9P1W9 311 aa5.91□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 CEP290O15078 2479 aa5.91□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 NFAT5O94916 1531 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 TRPM7Q96QT4 1865 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM88BA6NKF7 163 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 DLL1O00548 723 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 SSFA2P28290 1259 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 SOX11P35716 441 aa5.9□□□□□ -1.46
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ECHDC1-211ENST00000460558 LYPD8Q6UX82 237 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 MARVELD3Q96A59 401 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 PRR14Q9BWN1 585 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC87Q9NVE4 849 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-211ENST00000460558 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 LTBP1Q14766 1721 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 DLEC1Q9Y238 1755 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 LMNB1P20700 586 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 VAC14Q08AM6 782 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 SMIM5Q71RC9 77 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 KCTD17Q8N5Z5 321 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 PBXIP1Q96AQ6 731 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 THAP11Q96EK4 314 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 LRCH3Q96II8 777 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 HS3ST6Q96QI5 342 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 UCN2Q96RP3 112 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 PALLDQ8WX93 1383 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 RGPD2P0DJD1 1756 aa5.88□□□□□ -1.47
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ECHDC1-211ENST00000460558 RASSF10A6NK89 507 aa5.88□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 DGKZQ13574 1117 aa5.88□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 NR6A1Q15406 480 aa5.88□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 DEFB115Q30KQ5 88 aa5.88□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 BRICD5Q6PL45 260 aa5.88□□□□□ -1.47
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ECHDC1-211ENST00000460558 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa5.88□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 PASKQ96RG2 1323 aa5.88□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
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ECHDC1-211ENST00000460558 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa5.87□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa5.87□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 NLGN1Q8N2Q7 840 aa5.87□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 NBPF15Q8N660 670 aa5.87□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 TSC1Q92574 1164 aa5.87□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa5.87□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 AKAP11Q9UKA4 1901 aa5.86□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa5.86□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 RNF40O75150 1001 aa5.86□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 RASSF7Q02833 373 aa5.86□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 PDE4CQ08493 712 aa5.86□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 LDHDQ86WU2 507 aa5.86□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 USTQ9Y2C2 406 aa5.86□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 PARP3Q9Y6F1 533 aa5.86□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 CA12O43570 354 aa5.85□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 ECE1P42892 770 aa5.85□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 TMF1P82094 1093 aa5.85□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 ANKRD24Q8TF21 1146 aa5.85□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 CACNA1SQ13698 1873 aa5.84□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 TTC21AQ8NDW8 1320 aa5.84□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 IQCA1LA6NCM1 817 aa5.84□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 NR1H3Q13133 447 aa5.84□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 PTPRNQ16849 979 aa5.84□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 SCUBE3Q8IX30 993 aa5.84□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 ANKK1Q8NFD2 765 aa5.84□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 CAPNS2Q96L46 248 aa5.84□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa5.84□□□□□ -1.47
ECHDC1-211ENST00000460558 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
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