RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB43O43298 467 aa24.26■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 SPAG1Q07617 926 aa24.26■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa24.26■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.26■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP24.26■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP24.26■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa24.26■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 ANO6Q4KMQ2 910 aa24.26■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 TUBB4AP04350 444 aa24.25■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 WTAPQ15007 396 aa24.25■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.25■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 CNNM2Q9H8M5 875 aa24.25■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 SMC5Q8IY18 1101 aa24.25■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 ANXA1P04083 346 aa24.25■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.25■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 DCTPP1Q9H773 170 aa24.25■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP24.25■■□□□ 1.473e-7■□□□□ 9.3
CCSAP-201ENST00000284617 SKILP12757 684 aa24.24■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 GRM8O00222 908 aa24.24■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 ISM2Q6H9L7 571 aa24.24■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 TMX1Q9H3N1 280 aa24.24■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 GOPCQ9HD26 462 aa24.24■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.24■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 CTR9Q6PD62 1173 aa24.24■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 ALG1Q9BT22 464 aa24.24■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 TMCO5BA8MYB1 307 aa24.23■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 MAPKBP1O60336 1514 aa24.23■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 TCERG1LQ5VWI1 586 aa24.23■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 TTC41PQ6P2S7 1318 aa24.23■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 KSR2Q6VAB6 950 aa24.23■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 DACT1Q9NYF0 836 aa24.23■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM47Q96LD4 638 aa24.23■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa24.23■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.23■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC186Q7Z3E2 898 aa24.23■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 HOOK3Q86VS8 718 aa24.22■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 RAB3GAP1Q15042 981 aa24.22■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa24.22■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 IL15P40933 162 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 AKR1B10O60218 316 aa24.21■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 HS1BP3Q53T59 392 aa24.21■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 JADE2Q9NQC1 790 aa24.21■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 GIMAP7Q8NHV1 300 aa24.21■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 ESR2Q92731 530 aa24.21■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC175P0C221 793 aa24.21■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.47
CCSAP-201ENST00000284617 PPFIA3O75145 1194 aa24.2■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.2■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 EXOC1Q9NV70 894 aa24.2■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 ATP2B3Q16720 1220 aa24.2■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 NOP2P46087 812 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZUG5 572 aa24.2■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 TCEANC2Q96MN5 208 aa24.19■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 KRT222Q8N1A0 295 aa24.19■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 RTN1Q16799 776 aa24.19■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 PIK3C2GO75747 1445 aa24.18■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 RRAGBQ5VZM2 374 aa24.18■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 COPS6Q7L5N1 327 aa24.18■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.18■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa24.18■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.18■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.18■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 LINS1Q8NG48 757 aa24.18■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 MACROD2A1Z1Q3 448 aa24.18■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 VAMP4O75379 141 aa24.18■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 FBLN1P23142 703 aa24.18■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.18■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC2Q9BYS8 371 aa24.18■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 C6orf229H3BNL8 230 aa24.17■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 GNAQP50148 359 aa24.17■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 PIP4K2BP78356 416 aa24.17■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 VAT1LQ9HCJ6 419 aa24.17■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC172P0C7W6 258 aa24.17■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 CEP85Q6P2H3 762 aa24.17■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 GSTO1P78417 241 aa24.17■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 PTPRKQ15262 1439 aa24.17■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 HLA-DOAP06340 250 aa24.17■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.16■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 LMBR1LQ6UX01 489 aa24.16■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJC25Q9H1X3 360 aa24.16■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 ARFGAP3Q9NP61 516 aa24.16■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa24.16■■□□□ 1.46
CCSAP-201ENST00000284617 POLKQ9UBT6 870 aa24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms