RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254667.7

PTPRE-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type E, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRE, Length 5,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRE-201ENST00000254667 GCP02774 474 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRE-201ENST00000254667 A0A1W2PP64 1363 aa21.87■■□□□ 1.09
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PTPRE-201ENST00000254667 UQCRHP07919 91 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRE-201ENST00000254667 FAM114A1Q8IWE2 563 aa21.87■■□□□ 1.09
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PTPRE-201ENST00000254667 SNX21Q969T3 373 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRE-201ENST00000254667 USP25Q9UHP3 1055 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRE-201ENST00000254667 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PTPRE-201ENST00000254667 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PTPRE-201ENST00000254667 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PTPRE-201ENST00000254667 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.79■■□□□ 1.08
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