RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000041213.11

Cnppd1-201, Transcript of Protein CNPPD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cnppd1, Length 2,429 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Plcb3P51432 1234 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Sgsm2Q80U12 1005 aa16■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 NpeppsQ11011 920 aa15.99■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Ddx19aQ61655 478 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Q9D9S1 216 aa15.99■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Myh1Q5SX40 1942 aa15.99■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Vps33bP59016 617 aa15.99■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa15.99■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Polr3dQ91WD1 398 aa15.99■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 StrbpQ91WM1 672 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Kcnb2A6H8H5 907 aa15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Slc4a1P04919 929 aa15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Ftl2P49945 183 aa15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Ltv1Q6NSQ7 470 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Asap2Q7SIG6 958 aa15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Dmrt2Q8BG36 561 aa15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Krt25Q8VCW2 446 aa15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Gpr182P43142 395 aa15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Cpa2Q504N0 417 aa15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Cyp7a1Q64505 503 aa15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 PtmsQ9D0J8 101 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Pus3Q9JI38 481 aa15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Nphp3Q7TNH6 1325 aa15.98■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Zbtb38Q3LR78 1197 aa15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 ZyxQ62523 564 aa15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Slf2Q6P9P0 1278 aa15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Tmem266Q8BZB3 538 aa15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Nek11Q8C0Q4 628 aa15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Ankrd31A0A140LI88 1765 aa15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Gm45015A0A140LII9 184 aa15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Gm18336A0A140LIU8 765 aa15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Rnf20Q5DTM8 973 aa15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Esco1Q69Z69 843 aa15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 PogkQ80TC5 607 aa15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Tceanc2Q8R2M0 207 aa15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Bmp2kQ91Z96 1138 aa15.97■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Greb1lB9EJV3 1913 aa15.96■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Fkbp1aP26883 108 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Rab3gap1Q80UJ7 981 aa15.96■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Zkscan8Q8BSL0 588 aa15.96■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Cchcr1Q8K2I2 770 aa15.96■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Atf7Q8R0S1 413 aa15.96■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Bicdl1A0JNT9 577 aa15.96■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Mb21d2Q8C525 428 aa15.96■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Foxo4Q9WVH3 505 aa15.96■□□□□ 0.15
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Syt1P46096 421 aa15.95■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Pkp1P97350 728 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Vsig10D3YX43 558 aa15.95■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Mctp2Q5RJH2 878 aa15.95■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Erc1Q99MI1 1120 aa15.95■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa15.94■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 TnksQ6PFX9 1320 aa15.94■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Trim34bJ3QNR8 485 aa15.94■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Kank4Q6P9J5 1016 aa15.94■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Trim34aQ99PP6 485 aa15.94■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Rdm1Q9CQK3 281 aa15.94■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Psma5Q9Z2U1 241 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Mybbp1aQ7TPV4 1344 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Cyp2d10P24456 504 aa15.94■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Atp8a2P98200 1148 aa15.94■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Itga6Q61739 1091 aa15.94■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Lmbrd2Q8C561 694 aa15.94■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Plcd4Q8K3R3 807 aa15.94■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Mrpl50Q8VDT9 159 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Lrrfip2Q91WK0 415 aa15.94■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Ccne2Q9Z238 404 aa15.94■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Dctn1O08788 1281 aa15.93■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 TsksO54887 585 aa15.93■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa15.93■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Col22a1E9Q7P1 1613 aa15.93■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Atp2b3Q0VF55 1220 aa15.93■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 RubcnlQ3TD16 648 aa15.93■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Susd4Q8BH32 490 aa15.93■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Sp8Q8BMJ8 486 aa15.93■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Rbm17Q8JZX4 405 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Hmg20bQ9Z104 317 aa15.93■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Nol12Q8BG17 217 aa15.92■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 SnrkQ8VDU5 748 aa15.92■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa15.92■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 1700006A11RikB9EHI3 544 aa15.92■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Ifit1bl2Q3U687 466 aa15.92■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Rassf8Q8CJ96 419 aa15.92■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Smc3Q9CW03 1217 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Trip6Q9Z1Y4 480 aa15.92■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Bin2D3Z6Q9 489 aa15.91■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Rps6ka4Q9Z2B9 773 aa15.91■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Rps6kb1Q8BSK8 525 aa15.9■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Q8BT18 775 aa15.9■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Zfp804bA0A0G2JGH6 1343 aa15.9■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Cyp3a57D3YYZ0 503 aa15.9■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Cyp2c23E9Q5K4 494 aa15.9■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Ppil4Q9CXG3 492 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 IncenpQ9WU62 880 aa15.9■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Sh3bp5Q9Z131 463 aa15.9■□□□□ 0.14
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Prl7a2O54831 253 aa15.89■□□□□ 0.13
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Gtf3c5Q8R2T8 520 aa15.89■□□□□ 0.13
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 NgdnQ9DB96 315 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Lama4P97927 1816 aa15.89■□□□□ 0.13
Cnppd1-201ENSMUST00000041213 Smarcc1P97496 1104 aa15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 7.5 ms